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快速PCR条形码测序试剂盒-24
SQK-RPB114.24

借助PCR,为起始量在1-5ng的基因组DNA提供简便快捷的混样建库方法,实现多达24个样本的混样测序。

本品为一款早期试用产品。

本产品采用我们最新的试剂盒14系列试剂。

2早期试用
  • 获取 Oxford Nanopore Technologies 的最新产品
  • 在产品开发过程中向创新团队提供反馈
  • 因产品过新,最初质保期可能限于一个月
  • 产品随新增特性和功能而定期升级
  • 商店中显示预估交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望混样测序以降低单个样本的测序成本
  • 仅拥有少量起始gDNA
  • 需要一套简便的文库制备流程

本品为一款早期试用产品。

如需有关早期试用计划的更多信息,请参阅 本文了解产品的不同发布阶段

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

当单张测序芯片能产出的总数据量高于单个样本所需数据量时,将多个样本混样测序再进行条码拆分,可提高芯片的利用效率,并节省用户对单个样本的测序支出。

快速PCR条形码测序试剂盒-24 V14的特点:

特征详情
制备时间15 分钟 + PCR
起始材料要求每个样本 1-5 ng gDNA
是否需要PCR需要
片段化基于转座酶
读长~2 kb
试剂盒所用试剂试剂盒14系列(V14)
相关实验指南DNA快速建库测序 V14 - PCR条形码测序试剂盒-24 (SQK-RPB114.24)
包装大小6 次反应
稳定性输温度 2–8℃

长期存储温度 -20°C

Oxford Nanopore Technologies规定产品质保期为交付之日起三个月内。

快速PCR条形码试剂盒-24 V14 为低起始量gDNA(1-5 ng)的文库构建提供了最快速简便的方法,手动制备时间仅需约 15 分钟。

该试剂盒采用最新的试剂盒 14系列试剂,当与我们最新推出的纳米孔R10.4.1联用时,测序产出量高且原始序列准确率众数不低于99% (Q20+)。我们已重新调配测序芯片预处理试剂和测序试剂,以兼容经过改良的试剂盒14系列测序接头及R10.4.1纳米孔。

其它更新包括:接头的gDNA捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低;接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。

试剂盒的核心成分为转座酶。它能在切割模板分子的同时,将含有引物结合位点的标签连接至酶切端。试剂盒内含24种引物,用于扩增各样本并为其添加条形码及5’标签。该标签可促成含条码样本与快速测序文库接头的快速接合(不依赖连接酶)。混合扩增后的带条码样本,并向其中加入快速测序文库接头,即可得到用于测序的文库。

MinKNOW软件、独立的Guppy碱基识别工具和EPI2ME均支持混样测序数据的条码拆分,并根据条码将序列片段分类分配至相应文件夹。

更多信息:

当样本量不足时,可以采用PCR扩增的方式增加起始核酸量。而当样本纯度较低时,建库效率也会受到影响,此时可选择PCR特异性扩增成功连接PCR接头的分子,从而稀释或去除文库中的杂质。在大多数情况下,PCR扩增可大大提升由文库引起的低测序表现。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

快速PCR条形码试剂盒-24 V14 为低起始量gDNA(1-5 ng)的文库构建提供了最快速简便的方法,手动制备时间仅需约 15 分钟。

试剂盒的核心成分为转座酶。它能在切割模板分子的同时,将含有引物结合位点的标签连接至酶切端。试剂盒内含24种引物,用于扩增各样本并为其添加条形码及5’标签。该标签可促成含条码样本与快速测序文库接头的快速接合(不依赖连接酶)。混合扩增后的带条码样本,并向其中加入快速测序文库接头,即可得到用于测序的文库。

Chinese SQK-RPB004 Workflow

Protocols

请注册纳米孔社区账户,以获取上述实验指南。

What's in the box

快速PCR条形码测序试剂盒-24 V14可用于六次反应。

SQK-RPB114.24 tubes v1

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
快速条形码引物RLB01-2424(每管含一种条形码)透明15
片段化反应试剂FRM1琥珀色160
快速测序文库接头RAP1Green15
接头缓冲液ADB1透明100
AMPure XP 磁珠AXP3琥珀色1,200
洗脱缓冲液EB2黑色500
EDTAEDTA1蓝色700
测序缓冲液SB1红色700
文库颗粒LIB1粉色600
文库溶液LIS1白色管盖,粉色标签600
测序芯片冲洗液FCF1白色8,000
测序芯片系绳FCT1紫色200

sqk-rpb114.24 tubes

3rd party materials

耗材

  • LongAmp Taq 2X 预混液(如,NEB M0287)
  • (非必需)牛血清白蛋白 (BSA) (50 mg/mL) (例如Invitrogen™ UltraPure™ BSA (50 mg/mL) 目录号 AM2616)
  • 1.5ml Eppendorf DNA LoBind离心管
  • 0.2 ml薄壁PCR管
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • 新制备的80%乙醇(用无核酸酶水配制)
  • Qubit dsDNA HS Assay(双链DNA高灵敏度检测)试剂盒 (Invitrogen, Q32851)
  • Qubit™ 分析管 (Invitrogen, Q32856)

器材

  • 盛有冰的冰桶
  • 迷你离心机
  • 计时器
  • 热循环仪
  • 磁力架
  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • P1000 移液枪和枪头
  • P200 移液枪和枪头
  • P100 移液枪和枪头
  • P20 移液枪和枪头
  • P2 移液枪和枪头
  • 多通道移液枪
  • Qubit荧光计(或用于质控检测的等效仪器)

请注意: 以上列出的耗材和器材适用于标准的建库工作流程。如您将此试剂盒应用于其他工作流程,可能需要额外的第三方试剂。

Compatibility

试剂盒

  • 快速测序文库接头辅助扩展包 V14 (EXP-RAA114)
  • 测序辅助扩展包 V14 (EXP-AUX003)
  • 测序芯片清洗试剂盒(EXP-WSH004)
  • 测序芯片清洗试剂盒 XL (EXP-WSH004-XL)
  • 测序芯片预处理试剂盒 (EXP-FLP004)
  • 测序芯片预处理试剂盒 XL (EXP-FLP004-XL)

测序芯片

  • FLO-MIN114
  • FLO-PRO114M
  • FLO-FLG114

测序装置

  • MinION Mk1B
  • MinION Mk1C
  • GridION
  • PromethION
  • Flongle