Information
我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:
- 希望为多达96个样本混样测序以降低单个样本的测序成本
- 希望在短时间内制备文库
- 希望通过免扩增的方式混样建库,以保留碱基修饰等信息。
- 当前实验器材有限
请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。
当单张测序芯片能产出的总数据量高于单个样本所需数据量时,将多个样本混样测序再进行条码拆分,可提高芯片的利用效率,并节省用户对单个样本的测序支出。
快速条形码测序试剂盒-96 V14 的特点:
快速条形码测序试剂盒-96 V14(SQK-RBK114.96)为一款可独立使用的试剂盒,以操作简便速度快捷著称,且无需借助PCR扩增即可为多达96个样本建库并混样测序。本试剂盒的核心成分为转座酶。它能够在切割模板分子的同时,将带有条形码的标签连接至酶切端。本试剂盒内含96种不同条形码。
该试剂盒采用 最新的试剂盒 14系列试剂,当与我们最新推出的纳米孔R10.4.1联用时,原始序列准确率众数进一步提高且产出量增大。我们已重新调配测序芯片预处理试剂和测序试剂,以兼容经过改良的试剂盒14系列测序接头及R10.4.1纳米孔。
试剂盒14系列亦沿用了之前产品的优势,例如:接头的核酸链捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低;接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。
请注意:本试剂盒虽能产出质量值在Q20以上的高准确率测序数据,且可产出互补双链数据,但试剂盒以简便快捷为首要优化目标。如您对准确度有较高要求,我们推荐您使用我们的免扩增条形码测序试剂盒-96 V14(SQK-NBD114.96)。
尽管本试剂盒中的转座酶能片段化样本,但因本实验流程简单且仅涉及少量的样本操作(无纯化步骤且仅保留必要的移液步骤),因此当样本中含有长片段时,会输出一定量的长读长测序结果。如希望测序产出长读长,则起始材料中必须含有长片段。
本工作流程不涉及PCR扩增步骤,因此不存在扩增偏倚并保留了序列中的碱基修饰信息。您可使用纳米孔社区开发的工具对其进行分析。
更多信息:
本试剂盒推荐的每个样本的起始gDNA用量为200ng。如gDNA起始量少于200ng,则可能影响测序产出和读长。
运输和物流:
测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。
大陆地区工作日均可发货,根 据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。
Workflow
快速条形码测序试剂盒-96 V14 可为纯化的基因组DNA添加条码,完成混样建库。试剂盒的核心成分为转座酶,它能在切割模板分子的同时,将含条形码的标签连接至酶切端。混合各含条码样本后,使用SPRI磁珠纯化,再将快速测序文库接头与含条形码的标签端连接。
What's in the box
快速条形码测序试剂盒-96 V14 (SQK-RBK114.96)内含试剂可供十二次反应使用。
名称 | 缩写 | 管盖颜色 | 管数 | 溶液体积 (μl) |
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快速测序文库接头 | RA | 绿色 | 2 | 15 |
接头缓冲液 | ADB | 透明 | 1 | 100 |
AMPure XP 磁珠 | AXP | 琥珀色 | 3 | 1,200 |
洗脱缓冲液 | EB | 黑色 | 1 | 1,500 |
测序缓冲液 | SB | 红色 | 1 | 1,700 |
文库颗粒 | LIB | 粉色 | 1 | 1,800 |
文库溶液 | LIS | 白色管盖,粉色标签 | 1 | 1,800 |
测序芯片冲洗液 | FCF | 蓝色 | 1 | 15,500 |
测序芯片系绳 | FCT | 紫色 | 2 | 200 |
快速连接条形码 | RB01-96 | - | 3 盘 | 每孔 8 µl |
声明:本产品包含由贝克曼库尔特公司(Beckman Coulter, Inc)生产的 AMPure XP 试剂,并可与试剂盒一起于-20°C 下储存(试剂稳定性将不受损害)。
Compatibility
快速条形码测序试剂盒-96 V14 (SQK-RBK114.96)可与以下产品联用:
试剂盒
- 测序辅助扩展包 V14 (EXP-AUX003)
- 测序芯片清洗试剂盒 (EXP-WSH004)
- 测序芯片预处理试剂盒 V14 (EXP-FLP004)
- 测序芯片预处理试剂盒-XL (EXP-FLP004-XL)
- 快速测序文库接头辅助扩展包 V14 (EXP-RAA114)
- SARS-CoV-2长片段(Midnight)叠瓦式反转录扩增扩展包 (EXP-MRT001)
- Lambda 标准品扩展包 (EXP-CTL001)
测序芯片
R10.4.1:
- FLO-MIN114
- FLO-PRO114M
- FLO-FLG114
测序设备
- MinION Mk1B
- MinION Mk1C
- GridION
- PromethION