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快速条形码测序试剂盒-96 V14
SQK-RBK114.96

一种简便快捷的基因组 DNA 建库方法,支持多达96个基因组DNA样本的混样建库。

本品为一款早期试用产品

本试剂盒采用我们最新推出的试剂盒14系列试剂。

2早期试用
  • 获取 Oxford Nanopore Technologies 的最新产品
  • 在产品开发过程中向创新团队提供反馈
  • 因产品过新,最初质保期可能限于一个月
  • 产品随新增特性和功能而定期升级
  • 商店中显示预估交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望为多达96个样本混样测序以降低单个样本的测序成本
  • 希望在短时间内制备文库
  • 希望通过免扩增的方式混样建库,以保留碱基修饰等信息。
  • 当前实验器材有限

本品为一款早期试用产品。
如需有关早期试用计划的更多信息,请参阅 本文了解产品的不同发布阶段

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

当单张测序芯片能产出的总数据量高于单个样本所需数据量时,将多个样本混样测序再进行条码拆分,可提高芯片的利用效率,并节省用户对单个样本的测序支出。

快速条形码测序试剂盒-96 V14 的特点:

FeatureProperty
Preparation time60 minutes
起始材料要求则每个样本200ng基因组DNA
是否需要PCR不需要
片段化基于转座酶
读长随机分布;取决于起始材料的片段长度
试剂盒所用试剂试剂盒14系列试剂(V14)
相关实验指南基因组DNA快速建库测序 V14 - 条形码试剂盒 (SQK-RBK114.24或SQK-RBK114.96)
SARS-CoV-2 病毒叠瓦式扩增 - 快速条形码测序试剂盒-96 V14 联合 SARS-CoV-2长片段(Midnight)叠瓦式反转录扩增扩展包 (SQK-RBK114.96和EXP-MRT001)
快速建库测序 V14 - 质粒测序 (SQK-RBK114.24 或 SQK-RBK114.96)
快速建库测序 V14 - 扩增子测序 (SQK-RBK114.24 或 SQK-RBK114.96)
规格大小12 次反应
选择包括:制备三个含96种条形码的混样文库、六个含48种条形码的混样文库,或十二个含24种条形码的混样文库
保存运输温度 2–8℃
长期存储温度 -20℃
Oxford Nanopore Technologies 规定产品质保期为交付之日起三个月内。

快速条形码测序试剂盒-96 V14(SQK-RBK114.96)为一款可独立使用的试剂盒,以操作简便速度快捷著称,且无需借助PCR扩增即可为多达96个样本建库并混样测序。本试剂盒的核心成分为转座酶。它能够在切割模板分子的同时,将带有条形码的标签连接至酶切端。本试剂盒内含96种不同条形码。

该试剂盒采用最新的试剂盒 14系列试剂,当与我们最新推出的纳米孔R10.4.1联用时,原始序列准确率众数进一步提高且产出量增大。我们已重新调配测序芯片预处理试剂和测序试剂,以兼容经过改良的试剂盒14系列测序接头及R10.4.1纳米孔。

试剂盒14系列亦沿用了之前产品的优势,例如:接头的核酸链捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低;接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。

请注意:本试剂盒虽能产出质量值在Q20以上的高准确率测序数据,且可产出互补双链数据,但试剂盒以简便快捷为首要优化目标。如您对准确度有较高要求,我们推荐您使用我们的免扩增条形码测序试剂盒-96 V14(SQK-NBD114.96)

尽管本试剂盒中的转座酶能片段化样本,但因本实验流程简单且仅涉及少量的样本操作(无纯化步骤且仅保留必要的移液步骤),因此当样本中含有长片段时,会输出一定量的长读长测序结果。如希望测序产出长读长,则起始材料中必须含有长片段。

本工作流程不涉及PCR扩增步骤,因此不存在扩增偏倚并保留了序列中的碱基修饰信息。您可使用纳米孔社区开发的工具对其进行分析。

更多信息:

本试剂盒推荐的每个样本的起始gDNA用量为200ng。如gDNA起始量少于200ng,则可能影响测序产出和读长。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

快速条形码测序试剂盒-96 V14 可为纯化的基因组DNA添加条码,完成混样建库。试剂盒的核心成分为转座酶,它能在切割模板分子的同时,将含条形码的标签连接至酶切端。混合各含条码样本后,使用SPRI磁珠纯化,再将快速测序文库接头与含条形码的标签端连接。

What's in the box

快速条形码测序试剂盒-96 V14 (SQK-RBK114.96)内含试剂可供十二次反应使用。

SQK-RBK114.96 tubes v1

名称缩写管盖颜色管数溶液体积 (μl)
快速测序文库接头RA绿色215
接头缓冲液ADB透明1100
AMPure XP 磁珠AXP琥珀色31,200
洗脱缓冲液EB黑色11,500
测序缓冲液SB红色11,700
文库颗粒LIB粉色11,800
文库溶液LIS白色管盖,粉色标签11,800
测序芯片冲洗液FCF蓝色115,500
测序芯片系绳FCT紫色2200
快速连接条形码RB01-96-3 盘每孔 8 µl

声明:本产品包含由贝克曼库尔特公司(Beckman Coulter, Inc)生产的 AMPure XP 试剂,并可与试剂盒一起于-20°C 下储存(试剂稳定性将不受损害)。

3rd party materials

耗材

  • 1.5 ml Eppendorf DNA LoBind 离心管
  • 2 ml Eppendorf DNA LoBind 离心管
  • 0.2 ml薄壁PCR管
  • Eppendorf低吸附twin.tec®96孔PCR板,半裙边(目录号:0030129504)带热封
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • 新制备的80%乙醇(用无核酸酶水配制)
  • (非必需)牛血清白蛋白 (BSA) (50 mg/mL) (例如Invitrogen™ UltraPure™ BSA (50 mg/mL) 目录号 AM2616)

器材

  • 盛有冰的冰桶
  • 微孔板离心机,如Fisherbrand™ 微孔板迷你离心机 (Fisher Scientific, 目录号11766427)
  • 计时器
  • 温度设定为30℃及80℃的热循环仪或恒温加热仪
  • 磁力架
  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • P1000移液枪和枪头
  • P200移液枪和枪头
  • P100移液枪和枪头
  • P20移液枪和枪头
  • P2移液枪和枪头
  • 多通道移液枪

可选器材

  • Qubit荧光计(或用于质控检测的等效仪器)

Compatibility

快速条形码测序试剂盒-96 V14 (SQK-RBK114.96)可与以下产品联用:

试剂盒

  • 测序辅助扩展包 V14 (EXP-AUX003)
  • 测序芯片清洗试剂盒 (EXP-WSH004)
  • 测序芯片预处理试剂盒 V14 (EXP-FLP004)
  • 测序芯片预处理试剂盒-XL (EXP-FLP004-XL)
  • 快速测序文库接头辅助扩展包 V14 (EXP-RAA114)
  • SARS-CoV-2长片段(Midnight)叠瓦式反转录扩增扩展包 (EXP-MRT001)
  • Lambda 标准品扩展包 (EXP-CTL001)

测序芯片

R10.4.1:

  • FLO-MIN114
  • FLO-PRO114M
  • FLO-FLG114

测序设备

  • MinION Mk1B
  • MinION Mk1C
  • GridION
  • PromethION