Information
我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:
- 希望为24个以内的样本混样测序以降低单个样本的测序成本
- 希望原始序列准确度中位数达到Q20及以上(99%+)
- 希望通过优化测序实验以提高准确率和产出量
- 希望通过免扩增的方式混样建库,以保留碱基修饰等信息
- 需要控制读长
- 希望利用上游处理工序(如片段大小选择或全基因组扩增)以获得长读长
请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。
当单张测序芯片能产出的总数据量高于单个样本所需数据量时,将多个样本混样测序再进行条码拆分,可提高芯片的利用效率,并节省单个样本的测序支出。
免扩增条形码试剂盒-24 V14的特点:
免扩增条码测序试剂盒-24 V14 内含24种不同条码序列,可作为独立试剂盒用于双链DNA 样本(例如,基因组DNA及扩增子)的免扩增混样测序。
使用本试剂盒制备文库的方法与使用连接测序试剂盒相似:首先,使用NEBNext FFPE DNA修复混合液和NEBNext末端修复/dA尾添加模块对gDNA进行修复(请注意:如使用扩增子作为起始材料,则省略DNA修复步骤)和dA尾添加;接着将条形码接头的dT端与DNA的dA尾端连接;然后将带有不同条形码序列的样本混合,再将条形码接头的粘性末端与测序接头连接。
试剂盒经过优化,与我们最新推出的纳米孔R10.4.1联用时,测序产出量高且准确率不低于99% (Q20+)。我们已重新调配测序芯片预处理试剂和测序试剂,以兼容经过改良的试剂盒14系列测序接头及R10.4.1纳米孔。
试剂盒14系列亦沿用了之前产品的优势,例如:接头的核酸链捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低;接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。
如果实验需要长读长,我们建议您使用全长基因组DNA,而非片段化DNA。请注意:如需长读长,则起始材料中必须含有长片段。我们建议您使用Nanodrop测量A260/280 及 A260/230以确定样本纯度,且比例应满足以下标准:
- A260/280 = 1.8
- A260/230 = 2.0-2.2
免扩增条形码试剂盒-24 V14 兼容多种上游核酸处理工序,例如全基因组扩增(当样本量低于1 ng 时)及片段大小筛选(例如使用我们的短片段消除试剂盒(EXP-SFE001)富集特定长度的序列片段)。鉴于片段大小筛选对DNA消耗较大,如采用此步骤,我们建议您提高起始DNA 的用量。
MinKNOW、Guppy和EPI2ME支持混样测序数据的条码拆分,并按条码将序列片段分类分配至相应文件夹。
更多信息:
起始核酸量较少,或样本纯度较低时,会影响文库制备效率并降低测序通量。当样本量不足时,可以采用PCR扩增的方式增加起始核酸量。
运输和物流:
测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。
大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。
Workflow
使用本试剂盒制备文库的方法与使用连接测序试剂盒相似:首先,使用NEBNext FFPE DNA修复混合液和NEBNext末端修复/dA尾添加模块对gDNA进行修复(请注意:如使用扩增子作为起始材料,则省略DNA修复步骤)和dA尾添加;接着将条形码接头的dT端与DNA的dA尾端连接;然后将带有不同条形码序列的样本混合,再将条形码接头的粘性末端与测序接头连接。
What's in the box
免扩增条形码测序试剂盒-24 V14 内含24种不同条码序列,可 用于6个测序反应。
请注意: 我们正在将试剂盒中的条形码包装更改为96孔板形式。这一改动将减少塑料浪费,并支持自动化应用。
新的96孔板包装将在未来的批次中推出,请留意我们的产品发布公告。
孔板形式
名称 | 缩写 | 管盖颜色 | 管数 | 每管溶液体积 (μl) |
---|
DNA参照 | DCS | 黄色 | 2 | 35 |
免扩增接头 | NA | 绿色 | 1 | 40 |
测序缓冲液 | SB | 红色 | 1 | 700 |
文库颗粒 | LIB | 粉色 | 1 | 600 |
文库溶液 | LIS | 白色管盖,粉色标签 | 1 | 600 |
洗脱缓冲液 | EB | 黑色 | 2 | 500 |
AMPure XP 磁珠 | AXP | 透明管盖,浅青色标签 | 1 | 6,000 |
长片段缓冲液 | LFB | 橙色 | 1 | 1,800 |
短片段缓冲液 | SFB | 透明 | 1 | 1,800 |
EDTA | EDTA | 蓝色 | 1 | 700 |
测序芯片冲洗液 | FCF | 透明管盖,浅蓝色标签 | 1 | 8,000 |
测序芯片系绳 | FCT | 紫色 | 1 | 200 |
免扩增条形码孔板 | NB01-24 | - | 两板, 每板三套条形码组合 | 每孔15µl |
请注意: 本产品包含由贝克曼库尔特公司(Beckman Coulter, Inc)生产的 AMPure XP 试剂,并可与试剂盒一起于-20°C 下储存(试剂稳定性将不受损害)。
请注意: DNA参照(DCS)是一段可比对到Lambda基因组的3'端、长度为3.6 kb 的标准扩增子。
管装形式
名称 | 缩写 | 管盖颜色 | 管数 | 每管溶液体积 (μl) |
---|
免扩增条形码 | NB01-24 | 透明 | 24 (每种条形码一管) | 20 μl |
DNA参照 | DCS | 黄色 | 2 | 35 |
免扩增接头 | NA | 绿色 | 1 | 40 |
测序缓冲液 | SB | 红色 | 1 | 700 |
文库颗粒 | LIB | 粉色 | 1 | 600 |
文库溶液 | LIS | 白色管盖,粉色标签 | 1 | 600 |
洗脱缓冲液 | EB | 黑色 | 2 | 500 |
AMPure XP 磁珠 | AXP | 透明管盖,浅青色标签 | 1 | 6,000 |
长片段缓冲液 | LFB | 橙色 | 1 | 1,800 |
短片段缓冲液 | SFB | 透明 | 1 | 1,800 |
EDTA | EDTA | 蓝色 | 1 | 700 |
测序芯片冲洗液 | FCF | 透明管盖,浅蓝色标签 | 1 | 8,000 |
测序芯片系绳 | FCT | 紫色 | 1 | 200 |
请注意: 本产品包含由贝克曼库尔特公司(Beckman Coulter, Inc)生产的 AMPure XP 试剂,并可与试剂盒一起于-20°C 下储存(试剂稳定性将不受损害)。
请注意: DNA参照(DCS)是一段可比对到Lambda基因组的3'端、长度为3.6 kb 的标准扩增子。
Compatibility
免扩增条形码测序试剂盒-24 V14 可与以下产品联用:
试剂盒
- 免扩增条形码辅助试剂盒 V14 (EXP-NBA114)
- 测序芯片清洗试剂盒(EXP-WSH004)
- 测序芯片预处理试剂盒 V14 (EXP-FLP004)
- 测序芯片预处理试剂盒-XL(EXP-FLP004-XL)
- 测序辅助扩展包 V14 (EXP-AUX003)
- PCR条形码扩展包1-96 (EXP-PBC096)
- 长片段缓冲液扩展包(EXP-LFB001)
- 短片段缓冲液扩展包(EXP-SFB001)
测序芯片
R10.4.1.
- FLO-MIN114
- FLO-PRO114M
- FLO-FLG114
测序设备
- MinION Mk1B
- MinION Mk1C
- GridION
- PromethION