Information
我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:
- 希望为24个以内的样本混样测序以降低单个样本的测序成本
- 希望原始序列准确度中位数达到Q20及以上(99%+)
- 希望通过优化测序实验以提高准确率和产出量
- 希望通过免扩增的方式混样建库,以保留碱基修饰等信息
- 需要控制读长
- 希望利用上游处理工序(如片段大小选择或全基因组扩增)以获得长读长
请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。
当单张测序芯片能产出的总数据量高于单个样本所需数据量时,将多个样本混样测序再进行条码拆分,可提高芯片的利用效率,并节省单个样本的测序支出。
免扩增条形码试剂盒-24 V14的特点:
| 特征 | 详情 |
|---|
| 制备时间 | 140 分钟 |
| 起始材料要求 | • 如起始材料为gDNA,则每个样本 400-1000 ng • 如为扩增子,则每个样本 200 fmol (1 kb 扩增子对应130 ng) |
| 是否需要PCR | 不需要 |
| 片段化 | 可选 |
| 读长 | 等于片段长度 |
| 试剂盒所用试剂 | 试剂盒14系列试剂(V14) |
| 相关实验指南 | 请参阅 Protocols(实验指南) 一节。 |
| 包装规格 | 6个反应 |
| 储存 | -20°C 到 -30°C |
| 稳定性 | 本试剂盒在运输过程中可在不高于 25ºC 的条件下稳定保存 7 天。收到后,请置于 -20°C 至 -30°C 条件下保存。 Oxford Nanopore Technologies 规定产品质保期为交付之日起三个月内。 |
免扩增条码测序试剂盒-24 V14 内含24种不同条码序列,可作为独立试剂盒用于双链DNA样本(例如,基因组DNA及扩增子)的免扩增混样测序。
使用本试剂盒制备文库的方法与使用连接测序试剂盒相似:首先,使用NEBNext FFPE DNA修复混合液和NEBNext末端修复/dA尾添加模块对gDNA进行修复(请注意:如使用扩增子作为起始材料,则省略DNA修复步骤)和dA尾添加;接着将条形码接头的dT端与DNA的dA尾端连接;然后将带有不同条形码序列的样本混合,再将条形码接头的粘性末端与测序接头连接。
试剂盒经过优化,与我们最新推出的纳米孔R10.4.1联用时,测序产出量高且准确率不低于99% (Q20+)。我们已重新调配测序芯片预处理试剂和测序试剂,以兼容经过改良的试剂盒14系列测序接头及R10.4.1纳米孔。
试剂盒14系列亦沿用了之前产品的优势,例如:接头的核酸链捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低;接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。
如果实验需要长读长,我们建议您使用全长基因组DNA,而非片段化DNA。请注意:如需长读长,则起始材料中必须含有长片段。我们建议您使用Nanodrop测量A260/280 及 A260/230以确定样本纯度,且比例应满足以下标准:
- A260/280 = 1.8
- A260/230 = 2.0-2.2
免扩增条形码试剂盒-24 V14 兼容多种上游核酸处理工序,例如全基因组扩增(当样本量低于1 ng 时)及片段大小筛选(例如使用我们的短片段消除试剂盒(EXP-SFE001)富集特定长度的序列片段)。鉴于片段大小筛选对DNA消耗较大,如采用此步骤,我们建议您提高起始DNA的用量。
MinKNOW、Dorado和EPI2ME支持混样测序数据的条码拆分,并按条码将序列片段分类分配至相应文件夹。
更多信息:
起始核酸量较少,或样本纯度较低时,会影响文库制备效率并降低测序通量。当样本量不足时,可以采用PCR扩增的方式增加起始核酸量。
运输和物流:
测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。
大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。