Information
我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒：
- 希望为 SARS-CoV-2 全基因组测序
- 希望混样测序以降低单个样本的测序成本
请注意：使用本试剂盒，您需要购买额外的第三方试剂：详情请见“第三方材料”板块。
SARS-CoV-2长片段叠瓦式反转录扩增扩展包旨在与快速条形码试剂盒（SQK-RBK110.96）或快速条形码测序试剂盒（SQK-RBK114.96）联用，提供测序SARs-COV-2 RNA样本完整工作流程所需的全部试剂。
本扩展试剂盒集合了逆转录并叠瓦式扩增SARS-CoV-2 RNA样本片段所需的全部试剂和引物，因此用户无需额外添置。此扩展试剂盒借助叠瓦式扩增方法，生成以瓦片层叠形式覆盖SARS-CoV-2完整基因组的扩增子片段，再利用快速条形码试剂盒96（SQK-RBK110.96）为样本添加条码，然后混样测序。
本试剂盒中提供的引物最初由 Freed et al., 2020, 使用Primal Scheme设计。自2023年2月1日起，我们引入新的引物28，以应对观察到的 Omicron 变异株引发的脱落问题。随着 SARS-CoV-2 谱系中新突变的发现，我们将继续与社区（包括整个 ARTIC Nextwork、Nikki Freed、Olin Silander、Josh Quick、John Tyson、Nick Loman 等）密切合作，迅速作出响应，并保持Oxford Nanopore Technologies实验指南的更新，以确保 SARS-CoV-2 的全基因组测序具有最佳且稳定的表现。
MinKNOW及Guppy软件支持混样测序数据的条码拆分，并按条码将序列片段分类并分配至相应文件夹。
如仅需使用少部分条码混样测序，您可联系销售购买测序芯片清洗试剂盒。
SARS-CoV-2长片段（Midnight）叠瓦式反转录扩增扩展包的特点：
运输和物流：
测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。
大陆地区工作日均可发货，根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。
Workflow
SARS-CoV-2长片段叠瓦式反转录扩增扩展包（EXP-MRT001）借助叠瓦式扩增方法，生成的扩增子片段以瓦片层叠的形式覆盖整个SARS-CoV-2基因组。RNA样本首先经过逆转录，再利用A、B两组引物库分别对其进行叠瓦式扩增。接着将源自同一样本但不同引物库的PCR产物合并，再连接快速条形码，然后合并所有带条码样本，使用SPRI磁珠纯化。
What's in the box
SARS-CoV-2长片段叠瓦式反转录扩增扩展包可用于576个反转录/PCR反应。
| 名称 | 缩写 | 管盖颜色 | 管数 | 每管溶液体积 (μl) |
|---|
| LunaScript 5x浓缩反转录预混液 | LS RT | 蓝色 | 3 | 500 |
| Q5 热启动预混液 | Q5 | 橙色 | 6 | 1,500 |
| 长片段（Midnight）A组引物库 | MP A | 白色 | 3 | 15 |
| 长片段（Midnight）B组引物库 | MP B | 透明 | 3 | 15 |
Compatibility
此SARS-CoV-2长片段叠瓦式反转录扩增扩展包（EXP-MRT001）可与以下产品搭配使用：
试剂盒
- 快速条形码试剂盒（SQK-RBK110）
- 测序芯片清洗试剂盒（EXP-WSH004）
测序芯片
- FLO-MINSP6
- FLO-MIN106
- FLO-PRO002
测序仪
- MinION Mk1B
- MinION Mk1C
- GridION
- PromethION
