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微生物扩增子条形码测序试剂盒-24 V14
SQK-MAB114.24

对多达 24 个样品进行细菌 16S rRNA 和真菌 ITS 区域的扩增及混样全长测序。

本试剂盒为早期试用产品。

本产品采用试剂盒14系列试剂。

2早期试用
  • 获取 Oxford Nanopore Technologies 的最新产品
  • 在产品开发过程中向创新团队提供反馈
  • 因产品过新,最初质保期可能限于一个月
  • 产品随新增特性和功能而定期升级
  • 商店中显示预估交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

本试剂盒为早期试用产品。

本试剂盒适用于具有以下需求的用户:

  • 进行细菌 16S rRNA 和真菌 ITS 区域的全长测序
  • 实现细菌属水平的鉴定
  • 相较于连接法(ligation-based),在测序流程中更具速度与成本效益的优势
  • 采用无片段化(fragmentation-free)工作流程,以完整保留扩增子序列

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂。

*在单测序芯片上混样测序,可有效降低单个样本的测序成本。

微生物扩增子条形码测序试剂盒-24 V14 可从提取的 gDNA 中扩增完整的 16S rRNA 或 ITS 基因,并完成文库构建。该试剂盒配备了升级版引物,能够实现多种样本类型的 16S rRNA 全长测序(用于细菌谱分析)和 ITS 测序(用于真菌谱分析)。此外,全新的文库制备体系还具备拓展性,未来将支持用户使用自定义引物(如 18S 及其他扩增子样品)。

请注意: 本试剂盒所采用的引物方案符合行业标准,分别覆盖完整的 16S rRNA 基因和 ITS rRNA 基因。但由于引物结合区域在不同物种间并非完全保守,无法保证对所有物种均能成功扩增。建议您开展对照实验,以确认所研究的目标物种是否能够借助本试剂盒所提供的引物实现扩增。如需进一步支持,请联系support@nanoporetech.com

微生物扩增子条形码测序试剂盒-24 V14 的特点:

特征详情
制备时间60 分钟 + PCR
起始材料要求每个样本 10 ng gDNA
是否需要PCR需要
片段化不需要
读长全长 16S rRNA 基因和/或 ITS 区域
试剂盒所用试剂试剂盒14系列
相关实验指南16S 与 ITS 微生物扩增子条形码测序试剂盒(SQK-MAB114.24)
条码拆分选项• 微生物扩增子条形码测序试剂盒-24 V14
• 测序芯片清洗试剂盒
包装大小6次反应
储存-20°C 到 -30°C
稳定性本试剂盒在运输过程中可在不高于 25ºC 的条件下稳定保存 7 天。收到后,请置于 -20°C 至 -30°C 条件下保存。
Oxford Nanopore Technologies 规定产品质保期为交付之日起三个月内。

首先使用特异性 16S 或 ITS 引物对 DNA 进行 PCR 扩增(未来版本将支持用户自定义引物)。单次实验可为多达 24 个扩增子样本添加条形码。该条形码包含 5′ 端标签,可在无需连接酶的情况下促进样本与快速测序接头的连接。

本测序试剂盒采用试剂盒14系列试剂,当与最新推出的纳米孔 R10.4.1 联用时,可进一步提升原始序列的中位准确率并增大数据产出。试剂盒内含测序芯片预处理液及测序试剂,均与 R10.4.1 纳米孔兼容。试剂盒14系列试剂具备更高的 gDNA 捕获效率,可降低测序芯片的文库上样量;同时,所用接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。

本试剂盒受 EPI2ME wf-16S 工作流程支持,该流程可用于分析经微生物扩增子条形码测序试剂盒-24 V14(SQK-MAB114.24)测序脚本产出的数据。Dorado 及 EPI2ME 软件支持混样测序数据的条码拆分,并按条形码将序列片段分类并分配至相应文件夹。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

首先使用特异性 16S 或 ITS 引物对 DNA 进行 PCR 扩增(未来版本将支持用户自定义引物)。单次实验可为多达 24 个扩增子样本添加条形码。该条形码包含 5′ 端标签,可在无需连接酶的情况下促进样本与快速测序接头的连接。

注意:请将每个样本的 16S 与/或 ITS 扩增子分别处理。为获得最佳测序效果,我们建议您在同一测序芯片上仅测序同一类型的扩增子(如仅 16S 扩增子或仅 ITS 扩增子)。因此,一次测序可最多处理 24 个样本(全 16S 或全 ITS)。

Chinese_SQK-MAB114.24 Workflow

本试剂盒受 EPI2ME wf-16S 工作流程支持,该流程可用于分析经微生物扩增子条形码测序试剂盒-24 V14(SQK-MAB114.24)测序脚本产出的数据。Dorado 及 EPI2ME 软件支持混样测序数据的条码拆分,并按条形码将序列片段分类并分配至相应文件夹。

What's in the box

微生物扩增子条形码测序试剂盒-24 V14 包含 24 种不同的条形码,可供制备6次测序文库。

SQK-MAB11424_Kit_content

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
快速测序文库接头RA绿色115
16S 引物16S白色1800
ITS 引物ITS白色1800
短片段缓冲液SFB透明管盖, 白色色标签21,800
EDTAEDTA蓝色1700
接头缓冲液ADB透明1100
AMPure XP 磁珠AXP棕色21,200
洗脱缓冲液EB黑色1500
测序缓冲液SB红色1700
文库颗粒LIB粉色1600
文库溶液LIS白色管盖,粉色标签1600
测序芯片冲洗液FCF透明管盖,浅蓝色标签18,000
冲洗系绳 ULFTU紫色165
扩增子条形码 01-24AB24-板,每板三套条形码组合每孔 5 μl

请注意: 本产品包含由贝克曼库尔特公司(Beckman Coulter, Inc)生产的 AMPure XP 试剂,并可与试剂盒一起于-20°C 下储存(试剂稳定性将不受损害)。

3rd party materials

耗材:

  • Thermolabile Proteinase K (P8111)
  • LongAmp 热启动 Taq 2X 预混液 (NEB, M0533S)
  • 1.5ml Eppendorf DNA LoBind离心管
  • 0.2 ml薄壁PCR管
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • Qubit dsDNA HS Assay(双链DNA高灵敏度检测)试剂盒 (Invitrogen, Q32851)
  • Qubit™ 分析管 (Invitrogen, Q32856)

器材:

  • 盛有冰的冰桶
  • 迷你离心机
  • 计时器
  • 热循环仪
  • 磁力架
  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • P1000移液枪和枪头
  • P100移液枪和枪头
  • P20移液枪和枪头
  • P10移液枪和枪头
  • P2移液枪和枪头
  • 多通道移液枪
  • Qubit荧光计(或用于质控检测的等效仪器)

可选器材

  • Agilent生物分析仪(或等效仪器)
  • Eppendorf 5424 离心机(或等效器材)

Compatibility

试剂盒:

  • 快速测序文库接头辅助扩展包 V14 (EXP-RAA114)
  • 短片段缓冲液扩展包(EXP-SFB001)
  • 测序辅助扩展包 V14 (EXP-AUX003)
  • 测序辅助扩展包 XL (EXP-AUX003-XL)
  • 测序芯片清洗试剂盒 (EXP-WSH004)
  • 测序芯片清洗试剂盒 XL (EXP-WSH004-XL)
  • 测序芯片预处理试剂盒 (EXP-FLP004)
  • 测序芯片预处理试剂盒-XL (EXP-FLP004-XL)

测序芯片:

  • FLO-MIN114

测序设备:

  • MinION
  • GridION