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连接测序试剂盒-XL V14
SQK-LSK114-XL

一款为长读长和高原始序列准确率众数(Q20+,即99%及以上)量身打造的测序试剂盒,可灵活运用于多样本同时建库。

本试剂盒采用我们最新推出的试剂盒14系列试剂。

3发布
  • Oxford Nanopore Technologies 的产品已度过早期试用阶段
  • 用户可通过联系我们的客服提供反馈
  • 质保期延长至1-3个月
  • 产品不断演化,在升级前3个月内发布预告
  • 商店中显示交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望原始序列准确度众数达到Q20及以上(99%+)
  • 希望使用多通道移液枪或液体处理机器人同时处理多个样本
  • 希望通过优化测序实验以提高准确率
  • 需要控制读长
  • 希望利用上游处理工序(如片段大小选择或全基因组扩增)以获得长读长

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

连接测序试剂盒V14的特点:

特征详情
制备时间~60 分钟 手动操作
起始材料要求1 µg 双链基因组DNA 或100-200 fmol扩增子或cDNA
是否需要PCR不需要
片段化非必需;推荐的起始DNA用量为 100-500 ng
读长等于片段长度
相关实验指南基因组DNA连接法建库 (SQK-LSK114-XL)
多样本测序选项免扩增条形码试剂盒-24 V14 (SQK-NBD114.24)
免扩增条形码试剂盒-96 V14 (SQK-NBD114.96)
• 混样连接测序试剂盒-XL V14 (SQK-MLK114.96-XL)
包装大小48次反应
稳定性运输温度 2–8°C

长期存储温度 -20°C

Oxford Nanopore Technologies规定产品质保期为交付之日起三个月内。

连接测序试剂盒V14可简单灵活地为双链DNA样本(例如gDNA,cDNA或扩增子)制备测序文库。流程包括:使用NEBNext FFPE DNA修复混合液和NEBNext末端修复/dA尾添加模块对DNA末端进行修复和dA尾添加;再将试剂盒中提供的测序接头连接至DNA末端。

试剂盒经过优化,与我们最新推出的纳米孔R10.4.1联用时,测序产出量高且准确率不低于99% (Q20+)。我们已重新调配测序芯片预处理试剂和测序试剂,以兼容经过改良的试剂盒14系列测序接头及R10.4.1纳米孔。

试剂盒14系列亦沿用了之前产品的优势,例如:接头的核酸链捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低;接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。

用户可使用1 μg 基因组DNA、或 100-200 fmol短片段DNA(例如扩增子或cDNA)作为起始核酸用量。如果实验需要长读长,我们建议您使用全长基因组DNA,而非片段化DNA。请注意:如需长读长,则起始材料中必须含有长片段。我们建议您使用Nanodrop测量A260/280 及 A260/230以确定样本纯度,且比例应满足以下标准:

  • A260/280 = 1.8
  • A260/230 = 2.0-2.2

连接测序试剂盒V14兼容多种上游核酸处理工序,例如目标序列捕获富集,全基因组扩增(当样本量低于1 ng 时)及片段大小筛选(使用我们的短片段消除试剂盒(EXP-SFE001),富集特定长度的片段)。

SFE3 A) 单独使用连接测序试剂盒或搭配片段大小筛选(EXP-SFE001)为高分子量DNA建库测序时,所输出读长。B) 与EXP-SFE001联用产出的序列片段N50明显高于相同测序条件下,未经片段大小筛选的样本的N50。

免扩增的实验流程避免了扩增偏倚并保留了碱基修饰信息。使用纳米孔社区开发的工具即可对碱基修饰信息进行分析。

更多信息:

起始核酸量较少,或样本纯度较低时,会影响文库制备效率并降低测序通量。当样本量不足时,可以采用PCR扩增的方式增加起始核酸量。

Workflow

连接测序试剂盒可简单灵活地为双链DNA样本(例如gDNA,cDNA或扩增子)制备测序文库。流程包括:使用NEBNext FFPE DNA修复混合液和NEBNext末端修复/dA尾添加模块对DNA末端进行修复和dA尾添加;再将试剂盒中提供的测序接头连接至DNA末端。

Chinese SQK-LSK112 Workflow

What's in the box

此连接测序试剂盒-XL V14 可供制备48次文库。

SQK-LSK114-XL (1)

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
DNA 参照DCS黄色1100
连接接头LA绿色1320
连接缓冲液LNB白色11,500
洗脱缓冲液EB白色管盖,黑色标签110,000
长片段缓冲液LFB白色管盖,橙色标签220,000
短片段缓冲液SFB白色管盖,深蓝色标签220,000
文库颗粒LIB粉色21,800
文库溶液LIS白色管盖,粉色标签21,800
测序缓冲液SB红色31,700
测序芯片冲洗液FCF透明管盖,浅蓝色标签415,500
测序芯片系绳FCT紫色11,600

请注意: DNA参照(DCS)是一段可比对到Lambda基因组的3'端、长度为3.6 kb 的标准扩增子。

3rd party materials

耗材

  • 供Oxford Nanopore Technologies® 连接测序使用的NEBNext® 配套模块v2(NEB,E7672S或E7672L)
  • 1.5ml Eppendorf DNA LoBind离心管
  • 0.2ml薄壁PCR管
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • 新制备的70%乙醇(用无核酸酶水配制)
  • Qubit™ 分析管 (ThermoFisher Q32856)
  • Qubit dsDNA HS Assay(双链DNA高灵敏度检测)试剂盒
  • 牛血清白蛋白 (BSA) (50 mg/mL) (例如Invitrogen™ UltraPure™ BSA (50 mg/mL) 目录号 AM2616)
  • Agencourt AMPure XP 磁珠

器材

  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • 适用于1.5ml Eppendorf离心管的磁力架
  • 迷你离心机
  • 涡旋混匀仪
  • 热循环仪
  • P1000 移液枪和枪头
  • P200 移液枪和枪头
  • P100 移液枪和枪头
  • P20 移液枪和枪头
  • P10 移液枪和枪头
  • P2 移液枪和枪头
  • 盛有冰的冰桶
  • 计时器
  • Qubit荧光计 (或用于质控检测的等效仪器)

可选器材

  • Agilent生物分析仪(或等效仪器)
  • Eppendorf 5424离心机(或等效仪器)

Compatibility

连接测序试剂盒V14可与以下产品联用:

试剂盒

  • 测序芯片清洗试剂盒-XL(EXP-WSH004-XL)
  • Lambda 标准品扩展包 (EXP-CTL001)
  • 测序芯片预处理试剂盒 V14 (EXP-FLP004)
  • 测序芯片预处理试剂盒-XL (EXP-FLP004-XL)
  • 测序辅助扩展包 V14 (EXP-AUX003)
  • 长片段缓冲液扩展包 (EXP-LFB001)
  • 短片段缓冲液扩展包 (EXP-SFB001)

测序芯片

  • FLO-MIN114
  • FLO-PRO114M
  • FLO-FLG114

测序设备

  • MinION Mk1B
  • MinION Mk1C
  • GridION
  • PromethION