Information
我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:
- 希望原始序列准确度众数达到Q20及以上(99%+)
- 希望使用多通道移液枪或液体处理机器人同时处理多个样本
- 希望通过优化测序实验以提高准确率
- 需要控制读长
- 希望利用上游处理工序(如片段大小选择或全基因组扩增)以获得长读长
请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。
连接测序试剂盒V14的特点:
连接测序试剂盒V14可简单灵活地为双链DNA样本(例如gDNA,cDNA或扩增子)制备测序文库。流程包括:使用NEBNext FFPE DNA修复混合液和NEBNext末端修复/dA尾添加模块对DNA末端进行修复和dA尾添加;再将试剂盒中提供的测序接头连接至DNA末端。
试剂盒经过优化,与我们最新推出的纳米孔R10.4.1联用时,测序产出量高且准确率不低于99% (Q20+)。我们已重新调配测序芯片预处理试剂和测序试剂,以兼容经过改良的试剂盒14系列测序接头及R10.4.1纳米孔。
试剂盒14系列亦沿用了之前产品的优势,例如:接头的核酸链捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低;接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。
用户可使用1 μg 基因组DNA、或 100-200 fmol短片段DNA(例如扩增子或cDNA)作为起始核酸用量。如果实验需要长读长,我们建议您使用全长基因组DNA,而 非片段化DNA。请注意:如需长读长,则起始材料中必须含有长片段。我们建议您使用Nanodrop测量A260/280 及 A260/230以确定样本纯度,且比例应满足以下标准:
- A260/280 = 1.8
- A260/230 = 2.0-2.2
连接测序试剂盒V14兼容多种上游核酸处理工序,例如目标序列捕获富集,全基因组扩增(当样本量低于1 ng 时)及片段大小筛选(使用我们的短片段消除试剂盒(EXP-SFE001),富集特定长度的片段)。
A) 单独使用连接测序试剂盒或搭配片段大小筛选(EXP-SFE001)为高分子量DNA建库测序时,所输出读长。B) 与EXP-SFE001联用产出的序列片段N50明显高于相同测序条件下,未经片段大小筛选的样本的N50。
免扩增的实验流程避免了扩增偏倚并保留了碱基修饰信息。使用纳米孔社区开发的工具即可对碱基修饰信息进行分析。
更多信息:
起始核酸量较少,或样本纯度较低时,会影响文库制备效率并降低测序通量。当样本量不足时,可以采用PCR扩增的方式增加起始核酸量。
Workflow
连接测序试剂盒可简单灵活地为双链DNA样本(例如gDNA,cDNA或扩增子)制备测序文库。流程包括:使用NEBNext FFPE DNA修复混合液和NEBNext末端修复/dA尾添加模块对DNA末端进行修复和dA尾添加;再将试剂盒中提 供的测序接头连接至DNA末端。
What's in the box
此连接测序试剂盒-XL V14 可供制备48次文库。
名称 | 缩写 | 管盖颜色 | 管数 | 每管溶液体积 (μl) |
---|
DNA 参照 | DCS | 黄色 | 1 | 100 |
连接接头 | LA | 绿色 | 1 | 320 |
连接缓冲液 | LNB | 白色 | 1 | 1,500 |
洗脱缓冲液 | EB | 白色管盖,黑色标签 | 1 | 10,000 |
长片段缓冲液 | LFB | 白色管盖,橙色标签 | 2 | 20,000 |
短片段缓冲液 | SFB | 白色管盖,深蓝色标签 | 2 | 20,000 |
文库颗粒 | LIB | 粉色 | 2 | 1,800 |
文库溶液 | LIS | 白色管盖,粉色标签 | 2 | 1,800 |
测序缓冲液 | SB | 红色 | 3 | 1,700 |
测序芯片冲洗液 | FCF | 透明管盖,浅蓝色标签 | 4 | 15,500 |
测序芯片系绳 | FCT | 紫色 | 1 | 1,600 |
请注意: DNA参照(DCS)是一段可比对到Lambda基因组的3'端、长度为3.6 kb 的标准扩增子。