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连接测序试剂盒 V14
SQK-LSK114

一款为长读长和高原始序列准确率众数(Q20+,即99%及以上)量身打造的测序试剂盒。

本试剂盒采用我们最新推出的试剂盒14系列试剂。

3发布
  • Oxford Nanopore Technologies 的产品已度过早期试用阶段
  • 用户可通过联系我们的客服提供反馈
  • 质保期延长至1-3个月
  • 产品不断演化,在升级前3个月内发布预告
  • 商店中显示交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望原始序列准确度众数达到Q20及以上(99%+)
  • 希望通过优化测序实验以提高准确率
  • 需要控制读长
  • 希望利用上游处理工序(如片段大小选择或全基因组扩增)以获得长读长

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

连接测序试剂盒V14的特点:

特征详情
制备时间~65 分钟
起始材料要求1 µg 双链基因组DNA 或100-200 fmol扩增子或cDNA
是否需要PCR不需要
片段化非必需;推荐的起始DNA用量为 100-500 ng
读长等于片段长度
相关实验指南请参阅 Protocols(实验指南) 一节。
多样本测序选项• 免扩增条形码试剂盒-24 V14 (SQK-NBD114.24)
• 免扩增条形码试剂盒-96 V14 (SQK-NBD114.96)
• 连接法建库测序 V14 - PCR 条形码 (SQK-LSK114 联合 EXP-PBC001 或 EXP-PBC096)
• 混样连接测序试剂盒-XL V14 (SQK-MLK114.96-XL)
包装大小6次反应
储存-20°C 到 -30°C
稳定性本试剂盒在运输过程中可在不高于 25ºC 的条件下稳定保存 7 天。收到后,请置于 -20°C 至 -30°C 条件下保存。
Oxford Nanopore Technologies 规定产品质保期为交付之日起三个月内。

连接测序试剂盒V14可简单灵活地为双链DNA样本(例如gDNA,cDNA或扩增子)制备测序文库。流程包括:使用NEBNext FFPE DNA修复混合液和NEBNext末端修复/dA尾添加模块对DNA末端进行修复和dA尾添加;再将试剂盒中提供的测序接头连接至DNA末端。

试剂盒经过优化,与我们最新推出的纳米孔R10.4.1联用时,测序产出量高且准确率不低于99% (Q20+)。我们已重新调配测序芯片预处理试剂和测序试剂,以兼容经过改良的试剂盒14系列测序接头及R10.4.1纳米孔。

试剂盒14系列亦沿用了之前产品的优势,例如:接头的核酸链捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低;接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。

用户可使用1 μg 基因组DNA、或 100-200 fmol短片段DNA(例如扩增子或cDNA)作为起始核酸用量。如果实验需要长读长,我们建议您使用全长基因组DNA,而非片段化DNA。请注意:如需长读长,则起始材料中必须含有长片段。我们建议您使用Nanodrop测量A260/280 及 A260/230以确定样本纯度,且比例应满足以下标准:

  • A260/280 = 1.8
  • A260/230 = 2.0-2.2

连接测序试剂盒V14兼容多种上游核酸处理工序,例如目标序列捕获富集,全基因组扩增(当样本量低于1 ng 时)及片段大小筛选(使用我们的短片段消除试剂盒(EXP-SFE001),富集特定长度的片段)。

SFE3

A) 单独使用连接测序试剂盒或搭配片段大小筛选(EXP-SFE001)为高分子量DNA建库测序时,所输出读长。B) 与EXP-SFE001联用产出的序列片段N50明显高于相同测序条件下,未经片段大小筛选的样本的N50。

免扩增的实验流程避免了扩增偏倚并保留了碱基修饰信息。使用纳米孔社区开发的工具即可对碱基修饰信息进行分析。

更多信息:

起始核酸量较少,或样本纯度较低时,会影响文库制备效率并降低测序通量。当样本量不足时,可以采用PCR扩增的方式增加起始核酸量。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

连接测序试剂盒可简单灵活地为双链DNA样本(例如gDNA,cDNA或扩增子)制备测序文库。流程包括:使用NEBNext FFPE DNA修复混合液和NEBNext末端修复/dA尾添加模块对DNA末端进行修复和dA尾添加;再将试剂盒中提供的测序接头连接至DNA末端。

中文-LSK114 DNA Ligation Workflow

Protocols

基因组DNA连接法建库 (SQK-LSK114)
扩增子连接法建库 (SQK-LSK114)
基因组DNA连接法建库 - Lambda 对照 (SQK-LSK114)
基因组DNA连接法测序 V14 - 低起始量PCR扩增 (SQK-LSK114 联合 EXP-PCA001)
基因组DNA连接法测序 V14 - 直接cDNA测序 (SQK-LSK114)
使用 SQK-NBD114.24 进行简化甲基化测序(RRMS)
使用 SQK-LSK114 对人类细胞系来源的 30 kb 样本进行基因组变异测序
使用 SQK-LSK114 对人类细胞系来源的 15 kb 样本进行基因组变异测序
使用 SQK-LSK114 对人类细胞系来源的 10 kb 样本进行基因组变异测序
使用 SQK-LSK114 对提取自人类血液样本的约 30 kb 基因组 DNA 片段进行变异测序
使用 SQK-LSK114 对提取自人类血液样本的约 15 kb 基因组 DNA 片段进行变异测序
使用 SQK-LSK114 对人类唾液样本进行基因组变异测序
使用 SQK-LSK114 对人类口腔拭子样本进行基因组变异测序
基因组DNA连接法测序 V14 - 全基因组扩增 (SQK-LSK114)
基于10X Genomics 3’ cDNA的单细胞转录组测序实验指南:使用 SQK-LSK114 与 EXP-PCA001
基于10X Genomics 5’ cDNA的单细胞转录组测序实验指南:使用 SQK-LSK114
基于10X Genomics 3’ cDNA的空间转录组测序实验指南:使用 SQK-LSK114 与 EXP-PCA001
使用 SQK-LSK114 试剂盒对血液中的人源 cfDNA 进行单样本测序
使用 SQK-LSK114 试剂盒对细胞样本进行染色质可及性测序
24 小时基因组测序:从血液到数据分析的端到端工作流程
连接法测序 V14 - PCR 条形码(SQK-LSK114 联合 EXP-PBC001 或 EXP-PBC096)

What's in the box

此连接测序试剂盒V14可供制备六次文库。

SQK-LSK114 tubes v2

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
DNA 参照DCS黄色135
连接接头LA绿色140
AMPure XP 磁珠AXP琥珀色11,200
连接缓冲液LNB白色1200
长片段缓冲液LFB橙色21,800
短片段缓冲液SFB透明21,800
测序缓冲液SB红色1700
洗脱缓冲液EB黑色1500
文库颗粒LIB粉色1600
文库溶液LIS白色管盖,粉色标签1600
测序芯片冲洗液FCF透明管盖,浅蓝色标签68000
测序芯片系绳FCT紫色1200

请注意: 本产品包含由贝克曼库尔特公司(Beckman Coulter, Inc)生产的 AMPure XP 试剂,并可与试剂盒一起于-20°C 下储存(试剂稳定性将不受损害)。

请注意: DNA参照(DCS)是一段可比对到Lambda基因组3'端、长度为3.6 kb 的标准扩增子。

3rd party materials

耗材

  • 供Oxford Nanopore Technologies® 连接测序使用的NEBNext® 配套模块v2(NEB,E7672S或E7672L)
  • 1.5ml Eppendorf DNA LoBind离心管
  • 0.2ml薄壁PCR管
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • 新制备的80%乙醇(用无核酸酶水配制)
  • Qubit™ 分析管 (ThermoFisher Q32856)
  • Qubit dsDNA HS Assay(双链DNA高灵敏度检测)试剂盒
  • 牛血清白蛋白 (BSA) (50 mg/ml) (例如Invitrogen™ UltraPure™ BSA (50 mg/ml) 目录号 AM2616),配合 MinION 测序芯片使用

器材

  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • 适用于1.5ml Eppendorf离心管的磁力架
  • 迷你离心机
  • 涡旋混匀仪
  • 热循环仪
  • P1000 移液枪和枪头
  • P200 移液枪和枪头
  • P100 移液枪和枪头
  • P20 移液枪和枪头
  • P10 移液枪和枪头
  • P2 移液枪和枪头
  • 盛有冰的冰桶
  • 计时器
  • Qubit荧光计 (或用于质控检测的等效仪器)

可选器材

  • Agilent生物分析仪(或等效仪器)
  • Eppendorf 5424离心机(或等效仪器)

Compatibility

连接测序试剂盒V14可与以下产品联用:

试剂盒

  • 测序芯片清洗试剂盒(EXP-WSH004)
  • 测序芯片清洗试剂盒 XL (EXP-WSH004-XL)
  • Lambda 标准品扩展包 (EXP-CTL001)
  • PCR 条形码扩展包 1-12 (EXP-PBC001)
  • PCR 条形码扩展包 1-96 (EXP-PBC096)
  • 测序芯片预处理试剂盒 V14 (EXP-FLP004)
  • 测序芯片预处理试剂盒-XL (EXP-FLP004-XL)
  • 测序辅助扩展包 V14 (EXP-AUX003)
  • 测序辅助扩展包 XL (EXP-AUX003-XL)
  • PCR扩展包 (EXP-PCA001)
  • 短片段去除试剂盒(EXP-SFE001)
  • 长片段缓冲液扩展包 (EXP-LFB001)
  • 短片段缓冲液扩展包 (EXP-SFB001)

测序芯片

  • FLO-MIN114
  • FLO-PRO114M
  • FLO-FLG114

测序设备

  • Flongle
  • MinION
  • GridION
  • PromethION