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测序芯片清洗试剂盒 XL
EXP-WSH004-XL

本测序芯片清洗试剂盒可用于较大规模的MinION™ 和PromethION™测序芯片的清洗及再利用。

本品兼容所有测序试剂盒。

3发布
  • Oxford Nanopore Technologies 的产品已度过早期试用阶段
  • 用户可通过联系我们的客服提供反馈
  • 质保期延长至1-3个月
  • 产品不断演化,在升级前3个月内发布预告
  • 商店中显示交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望清洗测序芯片并使用新样本测序。
  • 希望按需为样品测序,而非批量测序。
  • 希望将测序芯片内累积的大量“不可用”孔恢复至可用状态。

清洗试剂盒特点:

特征详情
相关实验指南测序芯片清洗试剂盒 (EXP-WSH004 或 EXP-WSH004-XL)
相关试剂盒全部测序试剂盒
包装大小48 次反应

由于Oxford Nanopore平台可实时分析测序信息,并在MinKNOW用户界面上实时显示运行进程,因此当您采集到足量数据后,即可停止实验。测序芯片清洗试剂盒能高效去除芯片内的残留文库,且清洗过的芯片可立即投入使用。您也可将经过清洗后的芯片储存以备后用。本试剂盒可供48次清洗,且清洗过程只需两步。

测序芯片清洗试剂盒 XL(EXP-WSH004-XL)中的核酸酶能高效消化并去除芯片中的核酸:当再次用于测序时,芯片内前一文库残留量低至0.1%。由于清洗过的芯片内仍有少量样本残留,因此我们建议当您为多个样本依次测序时,请为每个样本连接不同条码,以便过滤之前实验的残存序列。

Figure 1

图 1. 为含四种条码的混样文库测序。测序完成后,使用试剂盒清洗测序芯片,并加入含另四种不同条码的混样文库,进行第二次测序。重复上述步骤,进行第三次测序。我们使用以上流程在四张不同测序芯片上进行了测试。

在使用核酸酶处理芯片后,为避免酶的残留活性影响后续测序实验,会先将核酸酶灭活,然后再储存芯片或为其重新上样。我们未观察到清洗芯片对测序读长造成影响。

Chinese WSH004XL read Length- bases sequenced

图 2. 芯片内的残余核酸酶已被灭活,可为芯片重新上样(或储存)。取部分制备好的文库上样至芯片(第一次上样)测序。一段时间后,停止测序并清洗芯片。从同一文库中,再取部分上样至该芯片(第二次上样)测序。再次重复清洗、上样和测序步骤(第三次上样)。三次上样产出的序列片段的读长分布未见明显差异,这表明测序芯片内的核酸酶经灭活后,残留活性极低。

使用测序芯片清洗试剂盒,提高芯片数据产出

测序时,如状态为“正在恢复”(详细视图中的对应状态为“不可用”)的纳米孔逐渐增多且数据采集速率下降,则意味着能接受并测序核酸链的纳米孔的数量在减少。我们发现,若此时对芯片进行清洗,则可将此类纳米孔恢复至“单孔”状态。

Chinese WSH004XL before and after wash Channel Count

_图 3.__ 因测序文库导致MinION 测序芯片内“不可用”通道大量累积,以致数据采集速度放缓:测序运行18小时后,芯片上可用于测序的纳米孔数量从最初的~1600个降至200个以内。经过清洗,状态为“单孔”的纳米孔数回升至 ~1000,大量纳米孔由“不可用”恢复至“单孔”状态。

我们发现,当测序产出因处于“正在恢复/不可用”状态的纳米孔增多而受到影响时,清洗芯片可将数据产量提高至少一倍。

Chinese WSH004XL Throughput-Run Time

图 4. 使用PromethION芯片进行文库测序所得产出:当数据采集速率因“不可用”孔数的增多而开始下降时,清洗芯片。每次清洗后的测序产出均较第一次清洗前增加一倍以上。

用户需使用测序辅助扩展包(EXP-AUX001)中提供的额外试剂,以将同一文库再次上样至清洗后的测序芯片。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Protocols

测序芯片清洗试剂盒 (EXP-WSH004 或 EXP-WSH004-XL)

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What's in the box

EXP-wsh004-XL tubes

名称缩写每管溶液体积 (μl)管盖颜色管数可用反应次数
清洗混合液WMX150棕色148
清洗稀释液DIL20,000白色管盖,棕色标签48
储存缓冲液S25,000白色管盖,黄色条标签148

Compatibility

测序芯片清洗试剂盒可与以下产品联用:

试剂盒

所有Oxford Nanopore DNA 测序试剂盒

测序芯片

  • FLO-MINSP6
  • FLO-MIN106D
  • FLO-PRO002

测序设备

  • MinION Mk1B
  • MinION Mk1C
  • GridION
  • PromethION