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直接 RNA 条形码测序试剂盒-24
SQK-DRB004.24

该试剂盒适用于条形码文库构建,支持对天然 RNA 样本进行混样测序。

2早期试用
  • 获取 Oxford Nanopore Technologies 的最新产品
  • 在产品开发过程中向创新团队提供反馈
  • 因产品过新,最初质保期可能限于一个月
  • 产品随新增特性和功能而定期升级
  • 商店中显示预估交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们强烈推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望通过混样建库降低单样本成本
  • 不希望引入 PCR 偏倚
  • 希望解析天然核糖核酸的碱基结构,如修饰碱基

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

直接 RNA 条形码测序试剂盒-24 的特点:

特征详情
制备时间~370 分钟
起始材料要求450 fmol poly(A)+ 富集 RNA,或 450 fmol 经 poly(A) 加尾的 IVT 转录本 RNA(总体积 5 μl)
是否需要PCR不需要
是否需要片段化不需要
读长与RNA长度相同
相关实验指南直接 RNA 测序 - 条形码混样建库(SQK-DRB004.24)
包装大小6 次建库反应
稳定性本试剂盒在运输过程中可在不高于 25ºC 的条件下稳定保存 7 天。收货后请按试剂盒标签标注的条件保存。
产品保质期为自收货之日起 3 个月。

直接 RNA 条形码测序试剂盒-24(SQK-DRB004.24)支持为多个天然 RNA 样本添加条形码并建库测序,无需先将 RNA 转换为 cDNA。起始材料可为 poly(A)+ 富集 RNA 样本或经 poly(A) 加尾的 IVT 转录本样本。

请注意: 本试剂盒已针对以下混样规模进行优化: 4–8 个 poly(A)+ 富集 RNA 样本,或 12-24 个经 poly(A) 加尾的 IVT 转录本样本。混样数量应结合单样本所需的测序产出确定。

该试剂盒在我们的 RNA 测序芯片(FLO-MIN004RA 和 FLO-PRO004RA)上可实现更高的测序产出,并提升原始序列准确率众数。试剂盒包含RNA 测序芯片专用的预处理试剂,并采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。

更多信息:

在不侧重直接RNA测序关键优势(碱基修饰识别及降低扩增偏倚)的应用场景中,建议您考虑使用单次实验产出更高的 Oxford Nanopore cDNA 建库试剂盒(SQK-PCS114 和 SQK-PCB114.24)。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

直接 RNA 条形码测序试剂盒-24(SQK-DRB004.24)适用于为多个天然 RNA 样本进行混样测序。该试剂盒以 poly(A)+ 富集 RNA 或经 poly(A) 加尾的 IVT 转录本为起始材料。首先,为每个 RNA 样本连接逆转录条形码,并将样本混合。随后对带条形码的 RNA 进行逆转录,完成第一链合成,以提高 RNA 的稳定性。接着,通过 USER 消化反应去除未正确连接到 RNA 的逆转录条形码突出端,以避免条形码交叉污染。最后,将测序接头连接至 RNA–cDNA 杂合分子上,进行测序。

Chinese_Direct_RNA_barcoding_workflow_with_pause_17March26

What's in the box

直接 RNA 条形码测序试剂盒-24(SQK-DRB004.24)包含 24 种条形码,并可支持最多 6 次建库反应。

SQK-DRB00424_Kit_content

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
RNA 条形码接头RBA绿色145
RNA 洗脱缓冲液REB黑色1300
置换链DS橙色110
测序缓冲液SB红色1700
文库溶液LIS白色瓶盖,粉色标签1600
EDTAEDTA蓝色1700
RNA 冲洗系绳RFT紫色1200
短片段缓冲液SFB透明瓶113,000
测序芯片冲洗液FCF透明瓶盖,浅蓝色标签18,000
逆转录条形码孔板RTB01-24-两板,每板三套条形码组合每孔 5µl

3rd party materials

耗材

  • T3 DNA 连接酶(NEB,M0317)
  • Induro® 逆转录酶 和 5x Induro® 逆转录反应缓冲液(NEB,M0681)
  • 小鼠 RNase 抑制剂(NEB,M0314)
  • USER (尿嘧啶-特异性切除试剂) 酶(NEB, M5505L)
  • Agencourt RNAClean XP磁珠 (Beckman Coulter®,A63987)
  • 10mM 脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP)溶液(例如 NEB N0447)
  • 5M 无 RNA 酶的氯化钠溶液 (ThermoFisher,10609823 或等效产品)
  • NEBNext 高起始量 Poly(A) mRNA 分离试剂盒(NEB,E3370)
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • Qubit™ RNA HS Assay(RNA高灵敏度检测)试剂盒(ThermoFisher,Q32852)
  • Qubit™ dsDNA HS Assay (双链DNA高灵敏度检测)试剂盒(ThermoFisher,Q32851)
  • Qubit™ 分析管(Invitrogen, Q32856)
  • 0.2 ml 薄壁 PCR 离心管 或 0.2 ml 96 孔 PCR 板
  • 1.5 ml Eppendorf DNA LoBind 离心管
  • PCR 封板膜

器材

  • 涡旋混匀仪
  • 迷你离心机
  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • 适用于1.5ml Eppendorf 离心管的磁力架
  • Eppendorf 5424 离心机(或等效器材)
  • 盛有冰的冰桶
  • 计时器
  • 热循环仪
  • Qubit™ 荧光计(或用于质控检测的等效仪器)
  • P1000 移液枪和枪头
  • P200 移液枪和枪头
  • P100 移液枪和枪头
  • P20 移液枪和枪头
  • P10 移液枪和枪头
  • P2 移液枪和枪头

请注意: 上述第三方试剂为标准建库流程所需。如您将该试剂盒应用于其它工作流程,可能需要额外的第三方试剂。

Compatibility

直接 RNA 条形码测序试剂盒-24 可与以下产品联用:

试剂盒

  • 直接 RNA 辅助扩展包(EXP-DRA004)
  • RNA 参照品扩展包(EXP-RCS001)

测序芯片

  • FLO-MIN004RA
  • FLO-PRO004RA

测序设备

  • MinION
  • GridION
  • PromethION