Products
ApplicationsStoreResources

Documentation

Find all the documentation needed for your nanopore experiments, including protocols and device manuals.

Nanopore Learning

Explore our online courses and video lessons to support your nanopore sequencing journey.

SupportAbout
直接 RNA 条形码测序试剂盒-24
SQK-DRB004.24

该试剂盒适用于条形码文库构建,支持对天然 RNA 样本进行混样测序。

2早期试用
  • 获取 Oxford Nanopore Technologies 的最新产品
  • 在产品开发过程中向创新团队提供反馈
  • 因产品过新,最初质保期可能限于一个月
  • 产品随新增特性和功能而定期升级
  • 商店中显示预估交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们强烈推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望通过混样建库降低单样本成本
  • 不希望引入 PCR 偏倚
  • 希望解析天然核糖核酸的碱基结构,如修饰碱基

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

直接 RNA 条形码测序试剂盒-24 的特点:

特征详情
制备时间~370 分钟
起始材料要求450 fmol poly(A)+ 富集 RNA,或 450 fmol 经 poly(A) 加尾的 IVT 转录本 RNA(总体积 5 μl)
是否需要PCR不需要
是否需要片段化不需要
读长与RNA长度相同
相关实验指南直接 RNA 测序 - 条形码混样建库(SQK-DRB004.24)
包装大小6 次建库反应
稳定性本试剂盒在运输过程中可在不高于 25ºC 的条件下稳定保存 7 天。收货后请按试剂盒标签标注的条件保存。
产品保质期为自收货之日起 3 个月。

直接 RNA 条形码测序试剂盒-24(SQK-DRB004.24)支持为多个天然 RNA 样本添加条形码并建库测序,无需先将 RNA 转换为 cDNA。起始材料可为 poly(A)+ 富集 RNA 样本或经 poly(A) 加尾的 IVT 转录本样本。

请注意: 本试剂盒已针对以下混样规模进行优化: 4–8 个 poly(A)+ 富集 RNA 样本,或 12-24 个经 poly(A) 加尾的 IVT 转录本样本。混样数量应结合单样本所需的测序产出确定。

该试剂盒在我们的 RNA 测序芯片(FLO-MIN004RA 和 FLO-PRO004RA)上可实现更高的测序产出,并提升原始序列准确率众数。试剂盒包含RNA 测序芯片专用的预处理试剂,并采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。

更多信息:

在不侧重直接RNA测序关键优势(碱基修饰识别及降低扩增偏倚)的应用场景中,建议您考虑使用单次实验产出更高的 Oxford Nanopore cDNA 建库试剂盒(SQK-PCS114 和 SQK-PCB114.24)。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

直接 RNA 条形码测序试剂盒-24(SQK-DRB004.24)适用于为多个天然 RNA 样本进行混样测序。该试剂盒以 poly(A)+ 富集 RNA 或经 poly(A) 加尾的 IVT 转录本为起始材料。首先,为每个 RNA 样本连接逆转录条形码,并将样本混合。随后对带条形码的 RNA 进行逆转录,完成第一链合成,以提高 RNA 的稳定性。接着,通过 USER 消化反应去除未正确连接到 RNA 的逆转录条形码突出端,以避免条形码交叉污染。最后,将测序接头连接至 RNA–cDNA 杂合分子上,进行测序。

Chinese_Direct_RNA_barcoding_workflow_with_pause_17March26

What's in the box

直接 RNA 条形码测序试剂盒-24(SQK-DRB004.24)包含 24 种条形码,并可支持最多 6 次建库反应。

SQK-DRB00424_Kit_content

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
RNA 条形码接头RBA绿色145
RNA 洗脱缓冲液REB黑色1300
置换链DS橙色110
测序缓冲液SB红色1700
文库溶液LIS白色瓶盖,粉色标签1600
EDTAEDTA蓝色1700
RNA 冲洗系绳RFT紫色1200
短片段缓冲液SFB透明瓶113,000
测序芯片冲洗液FCF透明瓶盖,浅蓝色标签18,000
逆转录条形码孔板RTB01-24-两板,每板三套条形码组合每孔 5µl

3rd party materials

耗材

  • T3 DNA 连接酶(NEB,M0317)
  • Induro® 逆转录酶 和 5x Induro® 逆转录反应缓冲液(NEB,M0681)
  • 小鼠 RNase 抑制剂(NEB,M0314)
  • USER (尿嘧啶-特异性切除试剂) 酶(NEB, M5505L)
  • Agencourt RNAClean XP磁珠 (Beckman Coulter®,A63987)
  • 10mM 脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP)溶液(例如 NEB N0447)
  • 5M 无 RNA 酶的氯化钠溶液 (ThermoFisher,10609823 或等效产品)
  • NEBNext 高起始量 Poly(A) mRNA 分离试剂盒(NEB,E3370)
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • Qubit™ RNA HS Assay(RNA高灵敏度检测)试剂盒(ThermoFisher,Q32852)
  • Qubit™ dsDNA HS Assay (双链DNA高灵敏度检测)试剂盒(ThermoFisher,Q32851)
  • Qubit™ 分析管(Invitrogen, Q32856)
  • 0.2 ml 薄壁 PCR 离心管 或 0.2 ml 96 孔 PCR 板
  • 1.5 ml Eppendorf DNA LoBind 离心管
  • PCR 封板膜

器材

  • 涡旋混匀仪
  • 迷你离心机
  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • 适用于1.5ml Eppendorf 离心管的磁力架
  • Eppendorf 5424 离心机(或等效器材)
  • 盛有冰的冰桶
  • 计时器
  • 热循环仪
  • Qubit™ 荧光计(或用于质控检测的等效仪器)
  • P1000 移液枪和枪头
  • P200 移液枪和枪头
  • P100 移液枪和枪头
  • P20 移液枪和枪头
  • P10 移液枪和枪头
  • P2 移液枪和枪头

请注意: 上述第三方试剂为标准建库流程所需。如您将该试剂盒应用于其它工作流程,可能需要额外的第三方试剂。

Compatibility

直接 RNA 条形码测序试剂盒-24 可与以下产品联用:

试剂盒

  • 直接 RNA 辅助扩展包(EXP-DRA004)
  • RNA 参照品扩展包(EXP-RCS001)

测序芯片

  • FLO-MIN004RA
  • FLO-PRO004RA

测序设备

  • MinION
  • GridION
  • PromethION