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16S条形码测序试剂盒-24 V14
SQK-16S114.24

通过添加条形码,为多达24个样本组成的混样文库进行“属”层级的细菌鉴定。

产品交货期:一周

本产品采用试剂盒14系列试剂。

3发布
  • Oxford Nanopore Technologies 的产品已度过早期试用阶段
  • 用户可通过联系我们的客服提供反馈
  • 质保期延长至1-3个月
  • 产品不断演化,在升级前3个月内发布预告
  • 商店中显示交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们推荐您在进行 16S 和 ITS 测序时,尝试我们新推出的微生物扩增子条形码测序试剂盒(SQK-MAB114.24)。

该试剂盒具有以下特点:

  • 采用更新的 16S 引物,相较于 SQK-16S114.24 试剂盒,可实现更优的物种检测能力;
  • 包含 ITS 引物,支持真菌物种鉴定。

16S 条形码测序试剂盒-24 V14(SQK-16S114.24)适用于具有以下需求的用户:

  • 希望进行16S测序
  • 希望进行“属”层级上的细菌鉴定

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

在单张芯片上进行混样测序,可有效降低用户对单个样本的测序支出。

16S条形码测序试剂盒可为源自不同样本的约1500 bp的16S rRNA基因进行扩增、添加条码并混样建库测序。该方法通过缩小测序范围至感兴趣的基因组区域,使用户在免于检测非必要区域的同时,了解样本中含有的全部微生物,加快了细菌鉴定的速度并节约了成本。且相比分析外显子集,分析完整的16S rRNA基因可获得更多信息。

请注意: 本试剂盒所采用的引物方案符合行业标准,覆盖完整的 16S rRNA 基因。但由于引物结合区域在不同物种间并非完全保守,无法保证对所有物种均能成功扩增。建议您开展对照实验,以确认所研究的目标物种是否能够借助本试剂盒所提供的引物实现扩增。如需进一步支持,请联系 support@nanoporetech.com

条形码测序试剂盒-24 V14 的特点:

特征详情
制备时间30 分钟 + PCR
起始材料要求每个样本 10 ng gDNA
是否需要PCR需要
片段化不需要
读长16S基因的全长 (~1.5 kb)
试剂盒所用试剂试剂盒14系列
相关实验指南[请参阅 Protocols(实验指南) 一节
条码拆分选项• 16S 条形码测序试剂盒-24 V14
• 测序芯片清洗试剂盒
包装大小6次反应
储存-20°C 到 -30°C
稳定性本试剂盒在运输过程中可在不高于 25ºC 的条件下稳定保存 7 天。收到后,请置于 -20°C 至 -30°C 条件下保存。
Oxford Nanopore Technologies 规定产品质保期为交付之日起三个月内。

DNA样本由特定的16S引物(27F 和 1492R)扩增。该引物序列中包含条形码及促进样本与快速测序接头接合的5’端标签(不依赖连接酶)。

该试剂盒采用最新的试剂盒 14系列试剂,当与我们最新推出的纳米孔R10.4.1联用时,原始序列准确率众数进一步提高且产出量增大。我们已重新调配测序芯片预处理试剂和测序试剂,以兼容经过改良的试剂盒14系列测序接头及R10.4.1纳米孔。

试剂盒14系列亦沿用了之前产品的优势,例如:接头的核酸链捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低;接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。

本试剂盒受EPI2ME 16S-BLAST工作流程支持,该流程可用于分析根据16S条形码测序试剂盒-24 V14(SQK-16S114.24)实验指南测序产出的数据。Dorado及EPI2ME软件支持混样测序数据的条码拆分,并按条码将序列片段分类并分配至相应文件夹。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

DNA样本由特定的16S引物(27F 和 1492R)扩增。该引物序列中包含条形码及促进样本与快速测序接头接合的5’端标签(不依赖连接酶)。本试剂盒内含24对引物。

本试剂盒受EPI2ME 16S-BLAST工作流程支持,该流程可用于分析根据16S条形码测序试剂盒-24 V14(SQK-16S114.24)实验指南测序产出的数据。Dorado及EPI2ME软件支持混样测序数据的条码拆分,并按条码将序列片段分类并分配至相应文件夹。

Chinese_16S Workflow

What's in the box

16S条形码测序试剂盒-24 V14 内含24种不同条码序列,可供制备六次文库。

SQK-16S114.24 Kit content

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
16S条形码引物 01-241-24-两板,每板3组每孔15 μl
快速测序文库接头RA绿色115
接头稀释缓冲液ADB透明1100
AMPure XP 磁珠AXP透明管盖,浅青色标签16,000
洗脱缓冲液EB黑色11,500
EDTAEDTA蓝色1700
测序缓冲液SB红色1700
文库颗粒LIB粉色1600
文库溶液LIS白色管盖,粉色标签1600
测序芯片冲洗液FCF透明管盖,浅蓝色标签18,000
测序芯片系绳FCT紫色1200

请注意: 本产品包含由贝克曼库尔特公司(Beckman Coulter, Inc)生产的 AMPure XP 试剂,并可与试剂盒一起于-20°C 下储存(试剂稳定性将不受损害)。

3rd party materials

耗材:

  • LongAmp 热启动 Taq 2X 预混液 (NEB, M0533S)
  • (非必需)牛血清白蛋白 (BSA) (50 mg/mL) (例如Invitrogen™ UltraPure™ BSA (50 mg/mL) 目录号 AM2616),配合 MinION 测序芯片使用
  • 1.5ml Eppendorf DNA LoBind离心管
  • 0.2 ml薄壁PCR管
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • 新制备的80%乙醇(用无核酸酶水配制)
  • Qubit dsDNA HS Assay(双链DNA高灵敏度检测)试剂盒 (Invitrogen, Q32851)
  • Qubit™ 分析管 (Invitrogen, Q32856)

器材:

  • 盛有冰的冰桶
  • 迷你离心机
  • 计时器
  • 热循环仪
  • 磁力架
  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • P1000移液枪和枪头
  • P100移液枪和枪头
  • P20移液枪和枪头
  • P10移液枪和枪头
  • P2移液枪和枪头
  • 多通道移液枪
  • Qubit荧光计(或用于质控检测的等效仪器)

可选器材

  • Agilent生物分析仪(或等效仪器)
  • Eppendorf 5424 离心机(或等效器材)

Compatibility

试剂盒:

  • 快速测序文库接头辅助扩展包 V14 (EXP-RAA114)
  • 测序辅助扩展包 V14 (EXP-AUX003)
  • 测序辅助扩展包 XL (EXP-AUX003-XL)
  • 测序芯片清洗试剂盒 (EXP-WSH004)
  • 测序芯片清洗试剂盒-XL (EXP-WSH004-XL)
  • 测序芯片预处理试剂盒 V14 (EXP-FLP004)
  • 测序芯片预处理试剂盒-XL (EXP-FLP004-XL)

测序芯片:

  • FLO-MIN114
  • FLO-FLG114

测序设备:

  • Flongle
  • MinION
  • GridION