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16S条形码测序试剂盒-24 V14
SQK-16S114.24

通过添加条形码,为多达24个样本组成的混样文库进行“属”层级的细菌鉴定。

本品为一款早期试用产品

产品交货期:一周

本产品采用试剂盒14系列试剂。

2早期试用
  • 获取 Oxford Nanopore Technologies 的最新产品
  • 在产品开发过程中向创新团队提供反馈
  • 因产品过新,最初质保期可能限于一个月
  • 产品随新增特性和功能而定期升级
  • 商店中显示预估交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望进行16S测序
  • 希望进行“属”层级上的细菌鉴定

本品为一款早期试用产品
如需有关早期试用计划的更多信息,请参阅 本文了解产品的不同发布阶段

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

在单张芯片上进行混样测序,可有效降低用户对单个样本的测序支出。

16S条形码测序试剂盒可为源自不同样本的约1500 bp的16S rRNA基因进行扩增、添加条码并混样建库测序。该方法通过缩小测序范围至感兴趣的基因组区域,使用户在免于检测非必要区域的同时,了解样本中含有的全部微生物,加快了细菌鉴定的速度并节约了成本。且相比分析外显子集,分析完整的16S rRNA基因可获得更多信息。

条形码测序试剂盒-24 V14 的特点:

特征详情
制备时间25 分钟 + PCR
起始材料要求每个样本 10 ng gDNA
是否需要PCR需要
片段化不需要
读长16S基因的全长 (~1.5 kb)
试剂盒所用试剂试剂盒14系列
相关实验指南DNA快速建库测序 - 16S 条形码测序试剂盒-24 V14 (SQK-16S114.24)
条码拆分选项• 16S 条形码测序试剂盒-24 V14
• 测序芯片清洗试剂盒
包装大小6次反应
稳定性运输温度 2–8℃

长期存储温度 -20℃

Oxford Nanopore Technologies规定产品质保期为交付之日起三个月内。

DNA样本由特定的16S引物(27F 和 1492R)扩增。该引物序列中包含条形码及促进样本与快速测序接头接合的5’端标签(不依赖连接酶)。

该试剂盒采用最新的试剂盒 14系列试剂,当与我们最新推出的纳米孔R10.4.1联用时,原始序列准确率众数进一步提高且产出量增大。我们已重新调配测序芯片预处理试剂和测序试剂,以兼容经过改良的试剂盒14系列测序接头及R10.4.1纳米孔。

试剂盒14系列亦沿用了之前产品的优势,例如:接头的核酸链捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低;接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。

本试剂盒受EPI2ME 16S-BLAST工作流程支持,该流程可用于分析根据16S条形码测序试剂盒-24 V14(SQK-16S114.24)实验指南测序产出的数据。Dorado及EPI2ME软件支持混样测序数据的条码拆分,并按条码将序列片段分类并分配至相应文件夹。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

DNA样本由特定的16S引物(27F 和 1492R)扩增。该引物序列中包含条形码及促进样本与快速测序接头接合的5’端标签(不依赖连接酶)。本试剂盒内含24对引物。

本试剂盒受EPI2ME 16S-BLAST工作流程支持,该流程可用于分析根据16S条形码测序试剂盒-24 V14(SQK-16S114.24)实验指南测序产出的数据。Dorado及EPI2ME软件支持混样测序数据的条码拆分,并按条码将序列片段分类并分配至相应文件夹。

Chinese SQK-16S024 Workflow

What's in the box

16S条形码测序试剂盒-24 V14 内含24种不同条码序列,可供制备六次文库。

SQK-16S114.24 Kit content

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
16S条形码引物 01-241-24-两板,每板3组每孔15 μl
快速测序文库接头RA绿色115
接头稀释缓冲液ADB透明1100
AMPure XP 磁珠AXP透明管盖,浅青色标签16,000
洗脱缓冲液EB黑色11,500
EDTAEDTA蓝色1700
测序缓冲液SB红色1700
文库颗粒LIB粉色1600
文库溶液LIS白色管盖,粉色标签1600
测序芯片冲洗液FCF透明管盖,浅蓝色标签18,000
测序芯片系绳FCT紫色1200

请注意: 本产品包含由贝克曼库尔特公司(Beckman Coulter, Inc)生产的 AMPure XP 试剂,并可与试剂盒一起于-20°C 下储存(试剂稳定性将不受损害)。

3rd party materials

耗材:

  • LongAmp 热启动 Taq 2X 预混液 (NEB, M0533S)
  • (非必需)牛血清白蛋白 (BSA) (50 mg/mL) (例如Invitrogen™ UltraPure™ BSA (50 mg/mL) 目录号 AM2616)
  • 1.5ml Eppendorf DNA LoBind离心管
  • 0.2 ml薄壁PCR管
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • 新制备的80%乙醇(用无核酸酶水配制)
  • Qubit dsDNA HS Assay(双链DNA高灵敏度检测)试剂盒 (Invitrogen, Q32851)
  • Qubit™ 分析管 (Invitrogen, Q32856)

器材:

  • 盛有冰的冰桶
  • 迷你离心机
  • 计时器
  • 热循环仪
  • 磁力架
  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • P1000移液枪和枪头
  • P100移液枪和枪头
  • P20移液枪和枪头
  • P10移液枪和枪头
  • P2移液枪和枪头
  • 多通道移液枪
  • Qubit荧光计(或用于质控检测的等效仪器)

可选器材

  • Agilent生物分析仪(或等效仪器)
  • Eppendorf 5424 离心机(或等效器材)

Compatibility

试剂盒:

  • 快速测序文库接头辅助扩展包 V14 (EXP-RAA114)
  • 测序辅助扩展包 V14 (EXP-AUX003)
  • 测序芯片清洗试剂盒 (EXP-WSH004)
  • 测序芯片清洗试剂盒-XL (EXP-WSH004-XL)
  • 测序芯片预处理试剂盒 V14 (EXP-FLP004)
  • 测序芯片预处理试剂盒-XL (EXP-FLP004-XL)

测序芯片:

  • FLO-MIN114
  • FLO-FLG114

测序设备:

  • MinION Mk1B
  • MinION Mk1C
  • GridION
  • Flongle