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Oxford Nanopore TechnologiesFully scalable, real-time DNA/RNA sequencing technology
Oxford Nanopore DiagnosticsLamPORE – rapid, low-cost, scalable detection of SARS-CoV-2
London Calling 2022
18th - 20th May
快速建库测序试剂盒
SQK-RAD004

一种简便快捷的基因组 DNA 建库方法。

本品包含一个测序芯片预处理试剂盒

3Released
  • Products from Oxford Nanopore Technologies that have completed their Early Access
  • Users can continue to provide feedback through feature request pinboard
  • Warranty periods extended to 1 – 3 months
  • Product continues to iterate with upgrade notifications of up to 3 months
  • Lead time visible in store
  • Product subject to availability

Information

我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望在短时间内制备文库
  • 当前实验器材有限

快速建库测序试剂盒仅需两个简单步骤在10分钟内即可为纯化的基因组DNA完成建库。本试剂盒的核心成分为转座酶。它能够在切割模板分子的同时,将转座酶接头连接至酶切端。随后,将快速测序文库接头与转座酶接头连接。

快速建库测序试剂盒的特点:

特征详情
制备时间10 分钟
起始材料要求400 ng 高分子量基因组DNA (<30 kb)
是否需要PCR不需要
片段化基于转座酶
读长随机分布,取决于起始材料的片段长度
产出序列片段类型1D
相关实验指南快速建库测序
Lambda标准品快速建库测序
全基因组扩增快速建库测序
混样测序选项• 快速条形码测序试剂盒
• 测序芯片清洗试剂盒
包装大小6次反应
稳定性运输温度 2–8℃

长期存储温度 -20℃

Oxford Nanopore Technologies 规定产品质保期为交付之日起三个月内。

该试剂盒以简便快捷为优化目标,而非达到最大通量。尽管本试剂盒中的转座酶能片段化样本,但因本实验流程简单且仅涉及少量的样本操作(无纯化步骤且仅保留必要的移液步骤),因此当样本中含有长片段时,会输出一定量的长读长测序结果。

Chinese RAD004 Typical ReadLenghth使用快速建库测序试剂盒制备E.coli文库的典型读长分布。

Chinese RAD004 Typical Throughput与连接法建库测序试剂盒相比,快速建库测序试剂盒的典型输出通量。

本工作流程不涉及PCR扩增步骤,因此不存在扩增偏差并保留了序列中的碱基修饰信息。您可使用纳米孔社区开发的工具对其进行分析。

更多信息:

本试剂盒针对含有长片段(>30 kb)的样本进行过优化,且推荐的起始gDNA用量为~400 ng。如gDNA起始量少于400ng或样本片段较短,则可能影响测序通量和读长。如起始样本量较低,您可考虑使用低起始量PCR测序试剂盒或低起始量快速PCR测序试剂盒。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

快速建库测序试剂盒仅需两个简单步骤在10分钟内即可为纯化的基因组DNA完成建库。本试剂盒的核心成分为转座酶。它能够在切割模板分子的同时,将转座酶接头连接至酶切端。随后,将快速测序文库接头与转座酶接头连接。

Chinese RAD004 Workflow

Protocols

快速建库测序
Lambda标准品快速建库测序标准对照实验
全基因组扩增快速建库测序

请您注册纳米孔社区账户,以获取上述实验指南。

What's in the box

此快速建库测序试剂盒可供制备六次文库。

RAD004 Content

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
Lambda DNALMD黄色188
片段化反应试剂FRA棕色130
快速测序文库接头RAP绿色110
测序系绳SQT紫色110
上样颗粒LB粉色1360
测序缓冲液SQB红色1300

测序芯片预处理试剂盒将一并供应:

Chinese FLP002 Content

名称缩写管盖颜色管数溶液体积
冲洗缓冲液FB蓝色61.17 ml
冲洗系绳FLT紫色1200 µl

3rd party materials

耗材

  • 1.5ml Eppendorf DNA LoBind离心管
  • 0.2 ml薄壁PCR管
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)

器材

  • 迷你离心机
  • 涡旋混匀仪
  • 温度设定在30℃ 和 80℃的热循环仪
  • P1000移液枪和枪头
  • P100移液枪和枪头
  • P20移液枪和枪头
  • P10移液枪和枪头
  • P2移液枪和枪头
  • 计时器

可选器材

  • Qubit荧光计(或用于质控检测的等效仪器)

如将本试剂盒用于下列用途,还需准备以下试剂:

全基因组扩增

  • Qiagen REPLI-g UltraFast Mini 试剂盒
  • 磷酸盐缓冲盐溶液 (PBS)

Compatibility

快速建库测序试剂盒可与以下产品联用:

试剂盒

  • 测序芯片清洗试剂盒(EXP-WSH004)

测序芯片

  • FLO-MINSP6
  • FLO-MIN106D
  • FLO-PRO002

测序仪

  • MinION Mk1B
  • MinION Mk1C
  • GridION
  • PromethION