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混样连接测序试剂盒-XL
SQK-MLK111.96-XL

一款经过优化的、免扩增且针对2-3个样本全基因组测序 (WGS)的试剂盒。

本品为早期试用产品

本产品采用试剂盒11系列试剂

2早期试用
  • 获取 Oxford Nanopore Technologies 的最新产品
  • 在产品开发过程中向创新团队提供反馈
  • 因产品过新,最初质保期可能限于一个月
  • 产品随新增特性和功能而定期升级
  • 商店中显示预估交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望提高测序实验通量
  • 希望对 2-3 个样本进行全基因组测序 (WGS)
  • 希望通过免扩增的方式混样建库,以保留碱基修饰等信息
  • 需要控制读长
  • 希望利用上游处理工序(如片段大小选择或全基因组扩增)
  • 希望使用多通道移液枪或移液机器人同时处理多个样本

本品为早期试用产品
如需有关早期试用计划的更多信息,请参阅 本文了解产品的不同发布阶段

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

特征详情
制备时间135 分钟手动建库, 245 分钟自动建库
起始材料要求每个样本 1 µg gDNA
是否需要PCR不需要
片段化可选; 推荐起始量为100 - 500 ng
读长等于片段长度
相关实验指南基因组DNA连接法测序-混样连接测序试剂盒-XL(SQK-MLK111.96-XL)
基因组DNA连接法测序-Hamilton NGS Star 96自动化移液工作站和混样连接测序试剂盒-XL(SQK-MLK111.96-XL)
包装大小48次反应
稳定性运输温度 2–8℃

长期存储温度 -20℃

Oxford Nanopore Technologies规定产品质保期为交付之日起三个月内。

作为一款独立试剂盒,混样连接测序试剂盒-XL内含96种不同条形码,可为基因组DNA和扩增子等双链DNA样本在免扩增的条件下添加条码。试剂盒提供的2-3个样本混样建库方案,为全基因组测序 (WGS) 的应用提供了更简单的工作流程,方便用户鉴别突变常见和易发区域。

使用本试剂盒进行文库制备的方法与使用连接法建库测序试剂盒相似:首先,使用NEBNext FFPE DNA修复混合液和NEBNext末端修复/dA尾添加模块对DNA末端进行修复和dA尾添加;接着将条形码接头的dT尾端与DNA的dA尾端连接;然后将带有不同条形码序列的样本混合,再将条形码接头的粘性末端与测序接头连接。

我们建议每个样本使用 1 μg gDNA。手动方案推荐于每张测序芯片上为两个样本测序,从而可在48张芯片上测序96个样本。我们亦全面支持使用Hamilton NGS Star 96移液工作站的自动化方案:用户可选择于每张测序芯片上为两个样本测序,或在两张芯片上三个样本测序。

本混样连接测序试剂盒-XL(“试剂盒11”系列)内所含的测序接头 II T(AMII T)具有以下两个主要特征:一,接头的核酸链捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低。二,接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

使用本试剂盒制备文库的方法与使用连接测序试剂盒相似:首先,使用NEBNext FFPE DNA修复混合液和NEBNext末端修复/dA尾添加模块对gDNA末端进行修复和dA尾添加;接着将条形码接头的dT端与DNA的dA尾端连接;然后将带有不同条形码序列的样本混合,再将条形码接头的粘性末端与测序接头连接。

Chinese Native Barcoding Kit 24 (Q20+) Workflow

What's in the box

混样连接测序试剂盒-XL内含试剂可支持48个反应:

sqk-mlk111.96-xl 1

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
测序接头 II TAMII T绿色1320
测序缓冲液 IISBII红色41,500
上样颗粒 IILBII粉色21,500
上样溶液LS白色管盖,粉色贴纸21,500
EDTAEDTA透明1700
洗脱缓冲液EB15 ml 小瓶110,000
长片段缓冲液LFB30 ml 小瓶315,000
冲洗缓冲液 XLFB30 ml 小瓶415,500
冲洗系绳FLT白色管盖,紫色贴纸11,600
面扩增条形码NB01-96不适用1 盘每孔 8 µl

3rd party materials

耗材

  • NEB Blunt/TA 连接酶预混液(M0367)
  • NEBNext®快速连接反应缓冲液(NEB 目录号 B6058)
  • 供Oxford Nanopore Technologies® 连接测序使用的NEBNext® 配套模块(目录号E7180S)。 或者,您也可以使用以下三种NEBNext®产品:
  • NEBNext FFPE修复混合液 (M6630)
  • NEBNext Ultra II末端修复/ dA尾添加模块 (E7546)
  • NEBNext 快速连接模块 (E6056)
  • 1.5ml Eppendorf DNA LoBind离心管
  • 0.2ml薄壁PCR管
  • Qubit™ 分析管 (ThermoFisher Q32856)
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • 新制备的70%乙醇(用无核酸酶水配制)
  • Agencourt AMPure XP 磁珠
  • Qubit dsDNA HS Assay(双链DNA高灵敏度检测)试剂盒

器材

  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • 迷你离心机
  • 磁力架
  • 涡旋混匀仪
  • 热循环仪
  • P1000 移液枪和枪头
  • P200 移液枪和枪头
  • P100 移液枪和枪头
  • P20 移液枪和枪头
  • P10 移液枪和枪头
  • P2 移液枪和枪头
  • 盛有冰的冰桶
  • 计时器
  • Qubit荧光计 (或用于质控检测的等效仪器)

Optional equipment

  • Agilent生物分析仪(或等效仪器)
  • Eppendorf 5424离心机(或等效仪器)

Compatibility

混样连接测序试剂盒可与以下产品联用:

试剂盒

  • 测序芯片清洗试剂盒(EXP-WSH004)
  • 测序辅助扩展包(EXP-AUX002)

测序芯片

  • FLO-PRO002

测序设备

  • PromethION