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Nanopore sequencing offers advantages in all areas of research. Our offering includes DNA sequencing, as well as RNA and gene expression analysis and future technology for analysing proteins.

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测序芯片清洗试剂盒
EXP-WSH004

清洗试剂盒可用于MinION™ 和PromethION™ 测序芯片的清洗和再利用。

Information

我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望清洗测序芯片并使用新样本重新测序。
  • 希望按需为样品测序,而非批量测序。
  • 希望将测序芯片内累积的大量“不可用”孔恢复至可用状态。

清洗试剂盒特点:

特征详情
制备时间60 分钟
相关实验指南测序芯片清洗试剂盒 (EXP-WSH004)
包装大小6次反应
稳定性运输温度 2–8℃

长期存储温度 -20℃

Oxford Nanopore Technologies规定产品质保期为交付之日起三个月内。

由于Oxford Nanopore平台能实时分析测序信息,因此当您采集到足量数据后,即可停止实验。测序芯片清洗试剂盒能高效去除芯片中的残留文库,且清洗过的芯片可立即投入使用。您也可将经过清洗后的芯片储存以备后用。本试剂盒可供六次清洗,且清洗过程只需两步。

EXP-WSH004中的核酸酶能高效消化并去除芯片中的核酸:当用于下次测序时,芯片内上一文库残留量低至0.1%。由于清洗过的芯片内仍有少量样本残留,因此我们建议当您为多个样本依次测序时,请为每个样本连接不同条码,以便过滤之前实验的残存序列。

Figure 1

图 1. 含四个条码的混样文库的测序表现。测序完成后,使用EXP-WSH004清洗测序芯片,并使用含四个不同条码的混样文库,进行第二次测序。重复上述步骤,进行第三次测序。如上图所示,EXP-WSH003 和 EXP-WSH004均能有效去除芯片内的剩余样本。

为避免芯片内核酸酶的残留活性影响后续测序实验,请先将其灭活,然后再储存或重新为芯片上样。我们未观察到清洗芯片影响测序读长。

WSH004 读长-测序碱基数

图 2. 芯片内的残余核酸酶已被灭活,可为芯片重新上样(或储存)。取部分制备好的文库上样至芯片(第一次上样)测序。一段时间后,停止测序并清洗芯片。从同一文库中,再取部分上样至该芯片(第二次上样)测序。再次重复清洗、上样和测序步骤(第三次上样)。三次上样产出的序列片段的读长分布未见明显差异,这表明测序芯片内的核酸酶经灭活后,残留活性极低。

用测序芯片清洗试剂盒,提高芯片数据产出

测序时,如状态为“正在恢复”(详细视图中的对应状态为“不可用”)的纳米孔逐渐增多且数据采集速率下降,则意味着能接受并测序核酸链的纳米孔的数量在减少。我们发现,若此时对芯片进行清洗,则可将此类纳米孔恢复至“单孔”状态。

WSH004  Chines Initial Lib Loading-Wash Flowcell Reloading

图 3. 因测序文库导致MinION 测序芯片内“不可用”通道大量累积,以致数据采集速度放缓:测序运行18小时后,芯片上可用于测序的纳米孔数量从最初的~1600个降至200个以内。经过清洗,状态为“单孔”的纳米孔数回升至 ~1000,大量纳米孔由“不可用”恢复至“单孔”状态。

我们发现,当测序通量因处于“正在恢复/不可用”状态的纳米孔增多而受到影响时,清洗芯片可将数据产量提高至少一倍。

WSH004  通量-运行时长

图 4. 使用PromethION芯片进行文库测序所得通量:当数据采集速率因“不可用”孔数的增多而开始下降时(如箭头所示),清洗芯片。每次清洗后的测序通量均较第一次清洗前增加至少一倍。

用户需使用测序辅助扩展包(EXP-AUX001)中提供的额外试剂,以将同一文库再次上样至清洗后的测序芯片。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒运输条件:2–8°C。 交付后,请将各产品存放于相应的长期储存条件下。

地区发货时间
美国、欧盟周一至周四
加拿大、挪威、韩国和日本加急形式,周一至周三
澳大利亚、新西兰周五
其它产品于周一发货,以留有整周的运输时间

相关价格详情, 请访问Nanopore中国商店(store.nanoporetech.net)。

What's in the box

Chinese WSH004 Content

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积
清洗混合液WMX棕色115 µl
稀释液DIL棕色21.3 ml
储存缓冲液S棕色21.6 ml

Compatibility

测序芯片清洗试剂盒可与以下产品联用:

试剂盒

所有Oxford Nanopore测序试剂盒

测序芯片

  • FLO-MINSP6
  • FLO-MIN106D
  • FLO-MIN111
  • FLO-PRO002

测序仪

  • MinION Mk1B
  • MinION Mk1C
  • GridION
  • PromethION