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Oxford Nanopore TechnologiesFully scalable, real-time DNA/RNA sequencing technology
Oxford Nanopore DiagnosticsLamPORE – rapid, low-cost, scalable detection of SARS-CoV-2
London Calling 2022
18th - 20th May
直接RNA测序试剂盒
SQK-RNA002

制备直接用于纳米孔测序的RNA文库

本品包含一个测序芯片预处理试剂盒

3Released
  • Products from Oxford Nanopore Technologies that have completed their Early Access
  • Users can continue to provide feedback through feature request pinboard
  • Warranty periods extended to 1 – 3 months
  • Product continues to iterate with upgrade notifications of up to 3 months
  • Lead time visible in store
  • Product subject to availability

Information

我们强烈推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 不希望引入逆转录或PCR偏倚
  • 转录本样本难以被逆转录
  • 望解析天然核糖核酸的碱基结构,如修饰碱基

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

直接RNA测序试剂盒的特点:

特征详情
制备时间105 分钟
起始材料要求500 ng 带PolyA尾的RNA
是否需要反转录可选
是否需要PCR不需要
读长与RNA长度相同
产出序列片段类型1D
典型序列片段数MinION/GridION上每张测序芯片可产出一百万条全长序列片段;PromethION上每张测序芯片可产出三百万条全长序列片段
相关实验指南直接RNA测序对照实验
直接RNA测序
目标RNA直接测序
多样本测序选项测序芯片清洗试剂盒
包装大小6 次反应
稳定性运输温度 2–8°C

长期存储温度 -20°C

Oxford Nanopore Technologies 规定产品质保期为交付之日起三个月内。

更多信息:

直接RNA测序试剂盒推出不久,其测序准确率和通量将随版本升级而不断提升。如实验并不侧重直接RNA测序带来的关键优势(碱基修饰识别及消除扩增偏倚),您可考虑使用当前产出通量更高的Oxford Nanopore cDNA试剂盒。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

与直接RNA测序试剂盒(SQK-RNA002)兼容的起始RNA类型包括真核生物mRNA、带polyA尾的病毒RNA,以及任何经polyA 加尾试剂盒制备的RNA。当与Oxford Nanopore测序仪联用时,您可使用直接RNA测序试剂盒(SQK-RNA002)为3´端带 polyA 尾的RNA制备文库,再进行单链测序。如样本RNA不含polyA尾(如tRNA或16S rRNA),您可按相关说明制备自定义接头,以便连接特定的3’端序列。本试剂盒所需的RNA起始量为500ng。

与将RNA逆转录为cDNA进行间接测序不同,直接RNA测序试剂盒对RNA本身进行测序。使用直接RNA测序试剂盒测序时,仅天然RNA通过纳米孔传感器,因此测序读长反映了样本中RNA分子的长度。

如用户在使用直接RNA测序试剂盒时加入逆转录步骤(非必需但推荐),测序通量会在cDNA不被测序的情况下有显著提升。

Chinese RNA002 workflow

Protocols

直接RNA测序对照实验
直接RNA测序
目标RNA直接测序

请注册纳米孔社区账户,以获取上述实验指南。

What's in the box

直接RNA测序试剂盒可供制备六次文库。

Chinese RNA002 Kit Content

名称缩写管盖颜色管数溶液体积 (μl)
逆转录接头RTA蓝色16
RNA测序接头RMX绿色136
RNA标准试样RCS黄色112
清洗缓冲液WSB橙色2900
洗脱缓冲液ELB黑色1246
RNA运行缓冲液RRB红色1450

测序芯片预处理试剂盒将一并供应:

Chinese FLP002 Content

名称缩写管盖颜色管数溶液体积 (μl)
冲洗缓冲液FB蓝色6975
冲洗系绳FLT紫色1180

3rd party materials

器材

  • 1.5ml Eppendorf DNA LoBind离心管
  • 0.2 ml薄壁PCR管
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • 新制备的70%乙醇(用无核酸酶水配制)
  • SuperScript III逆转录酶(Thermo Fisher Scientific,18080044)
  • 10mM 脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP)溶液(例如 NEB 目录号N0447)
  • NEBNext®快速连接反应缓冲液(NEB目录号 B6058)
  • 2M U/ml的T4 DNA连接酶 (NEB目录号 M0202)
  • Agencourt RNAClean XP磁珠
  • Qubit RNA HS Assay(RNA高灵敏度检测)试剂盒(ThermoFisher 目录号Q32852)
  • Qubit dsDNA HS Assay(双链DNA高灵敏度检测)试剂盒(ThermoFisher 目录号Q32851)

器材

  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • 磁力架
  • 迷你离心机
  • 涡旋混匀仪
  • 盛有冰的冰桶
  • 计时器
  • 热循环仪
  • P1000移液枪和枪头
  • P100移液枪和枪头
  • P20移液枪和枪头
  • P10移液枪和枪头
  • P2移液枪和枪头

可选器材

  • Agilent生物分析仪(或等效仪器)
  • Qubit荧光计(或用于质控检测的等效仪器)
  • Eppendorf 5424 离心机(或等效器材)

Compatibility

直接RNA测序试剂盒可与以下产品联用:

试剂盒

  • 测序芯片清洗试剂盒(EXP-WSH004)

测序芯片

  • FLO-MINSP6
  • FLO-MIN106D
  • FLO-PRO002

测序仪

  • MinION Mk1B
  • MinION Mk1C
  • GridION
  • PromethION