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Oxford Nanopore TechnologiesFully scalable, real-time DNA/RNA sequencing technology
Oxford Nanopore DiagnosticsLamPORE – rapid, low-cost, scalable detection of SARS-CoV-2
London Calling 2022
18th - 20th May
PCR-cDNA测序试剂盒
SQK-PCS109

用于全长转录本的高通量测序和定量。

本品包含一个测序芯片预处理试剂盒

3Released
  • Products from Oxford Nanopore Technologies that have completed their Early Access
  • Users can continue to provide feedback through feature request pinboard
  • Warranty periods extended to 1 – 3 months
  • Product continues to iterate with upgrade notifications of up to 3 months
  • Lead time visible in store
  • Product subject to availability

Information

我们强烈推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 起始样本有限
  • 希望提高测序实验通量
  • 希望识别并量化全长转录本
  • 希望分析差异基因表达或差异转录本使用率
  • 希望鉴定并定量异构体、剪接变体及融合转录本

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

PCR-cDNA测序试剂盒可为低至1 ng的起始材料(即带poly-A尾的RNA)制备用于纳米孔测序的cDNA文库。用户亦可使用50ng 未经poly-A尾富集操作的总RNA作为起始材料,但可能需对实验条件进行额外优化

本试剂盒提供的寡核苷酸可为带poly-A尾的全长RNA进行互补链合成和链转换。再借助含5’端标签的引物合成双链cDNA。该标签可促成样本与快速测序接头的快速接合(不依赖连接酶)。

PCR-cDNA测序试剂盒的特点:

特征详情
制备时间165 分钟
起始材料要求1 ng 含poly-A尾的RNA或50 ng 总RNA
是否需要反转录需要
是否需要PCR需要
读长PCR扩增富集的全长cDNA
产出序列片段类型1D
常规序列片段数MinION/GridION上每张测序芯片可产出七百至一千二百万或更多条全长序列片段; PromethION上每张测序芯片可产出不少于五千万条全长序列片段
相关实验指南cDNA-PCR 测序

序列特异性cDNA-PCR 测序
条码拆分选项• PCR-cDNA条形码测序试剂盒
• 测序芯片清洗试剂盒
包装大小6次反应
稳定性运输温度 2–8°C

长期存储温度 -20°C

Oxford Nanopore Technologies规定产品质保期为交付之日起三个月内。

更多信息

PCR-cDNA条形码测序试剂盒(SQK-PCB109)可替代PCR-cDNA测序试剂盒,为多达12个不同的RNA样本添加条码,实现在同一张上芯片的混样测序。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

首先使用本试剂盒提供的寡核苷酸,对含poly-A尾的全长RNA进行互补链合成和链转换。再借助含5’端标签的引物合成双链cDNA。该标签可促成样本与快速测序接头的快速接合(不依赖连接酶)。

Chinese PCS109 Workflow

Protocols

cDNA-PCR 测序

序列特异性cDNA-PCR 测序

请注册纳米孔社区账户,以获取上述实验指南。

What's in the box

PCR-cDNA测序试剂盒可供制备六次文库。

Chinese 2019 01 25 SQK-PCS109 contents

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
简并性引物VNP蓝色1200
模板链转换引物SSP粉色1160
cDNA 引物cPRM灰色140
洗脱缓冲液EB黑色2200
快速测序文库接头RAP绿色110
测序缓冲液SQB红色2300
测序系绳SQT紫色110
上样颗粒LB粉色1360

测序芯片预处理试剂盒将一并供应。

Chinese FLP002 Content

名称缩写管盖颜色管数溶液体积 (μl)
冲洗缓冲液FB蓝色61.17 ml
冲洗系绳FLT紫色1200 µl

3rd party materials

耗材

  • 1.5ml Eppendorf DNA LoBind离心管
  • 0.2 ml薄壁PCR管
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • 新制备的70%乙醇(用无核酸酶水配制)
  • Agencourt AMPure XP磁珠
  • 10mM 脱氧核糖核苷三磷酸(dNTP)溶液(例如,NEB 目录号 N0447)
  • LongAmp Taq 2X 预混液(如,NEB 目录号 M0287)
  • Maxima H Minus 逆转录酶(200 U/µL),与 5X RT 缓冲液一起提供(ThermoFisher,目录号 EP0751)
  • RNaseOUT™,40 U/μl (Life Technologies,目录号 10777019)
  • 核酸外切酶I (NEB,目录号 M0293)

器材

  • Hula混匀仪(低速旋转式混匀仪)
  • 磁力架
  • 迷你离心机
  • 涡旋混匀仪
  • 盛有冰的冰桶
  • 计时器
  • 热循环仪
  • P1000移液枪和枪头
  • P100移液枪和枪头
  • P20移液枪和枪头
  • P10移液枪和枪头
  • P2移液枪和枪头
  • 适用于200 µl离心管的、置于-20℃下预冷的低温冰浴盒(例如,Eppendorf 目录号 022510509)

可选器材

  • Agilent生物分析仪(或等效仪器)
  • Qubit荧光计(或用于质控检测的等效仪器)
  • Eppendorf 5424 离心机(或等效器材)

Compatibility

PCR-cDNA测序试剂盒可与以下产品联用:

试剂盒

  • 测序芯片清洗试剂盒(EXP-WSH004)

测序芯片

  • FLO-MINSP6
  • FLO-MIN106D
  • FLO-PRO002

测序仪

  • MinION Mk1B
  • MinION Mk1C
  • GridION
  • PromethION