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PCR-cDNA条形码测序试剂盒
SQK-PCB111.24

用于全长转录本的高通量测序和定量,可实现多达24个样本的混样测序。

此试剂盒采用我们的试剂盒11系列试剂。

本品为早期试用产品

2早期试用
  • 获取 Oxford Nanopore Technologies 的最新产品
  • 在产品开发过程中向创新团队提供反馈
  • 因产品过新,最初质保期可能限于一个月
  • 产品随新增特性和功能而定期升级
  • 商店中显示预估交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 起始样本有限
  • 希望混样测序以降低单个样本的测序成本
  • 希望优化测序实验以提高产出
  • 希望识别并量化全长转录本
  • 希望分析差异基因表达
  • 希望鉴定并定量异构体、剪接变体及融合转录本

本品为一款早期试用产品
如需有关早期试用计划的更多信息,请参阅 本文了解产品的不同发布阶段

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

PCR-cDNA条形码测序试剂盒-24的特点:

特征详情
制备时间~210 分钟 + PCR
起始材料要求4 ng 含poly-A尾的RNA 或 200ng总RNA
是否需要逆转录需要
是否需要PCR需要
读长PCR扩增富集的全长cDNA
试剂盒所用试剂试剂盒11系列试剂
相关实验指南PCR-cDNA 条形码测序试剂盒-24 (SQK-PCB111.24)
多样本测序选项测序芯片清洗试剂盒(EXP-WSH004)
测序辅助扩展包(EXP-AUX001)
包装大小6次反应

当单张测序芯片能产出的总数据量高于单个样本所需数据量时,将多个样本混样测序再进行条码拆分,可提高芯片的利用效率,并节省单个样本的测序支出。

PCR-cDNA条码测序试剂盒可为多达24个样本制备用于纳米孔测序的cDNA文库。且起始材料(即带poly-A尾的RNA)的用量可低至4 ng。用户亦可使用200ng 未经poly-A尾富集操作的总RNA作为起始材料,但可能需对实验条件进行额外优化。

实验通过链转换筛选出可用于剪接变体识别的全长转录本。首先使用本试剂盒提供的寡核苷酸,对含poly-A尾的全长RNA进行互补链合成和链转换。试剂盒内含24对不同引物,用于生成并PCR扩增双链cDNA。扩增引物内含5'端标签,可促成样本与快速测序接头的快速接合(不依赖连接酶)。混合扩增后的带条码样本,并向其中加入快速测序文库接头,即可得到用于测序的文库。

本cDNA试剂盒(“试剂盒11”系列)内所含的快速测序文库接头 T(RAP T)具有以下两个主要特征:一,接头的核酸链捕获率更高,因此测序芯片的文库上样量更低。二,接头采用能量稳固技术,免去用户在操作用时较长的测序实验时,中途向芯片添加额外能量。

此试剂盒内亦包含cDNA逆转录接头和逆转录引物,旨在从转录本末端合成cDNA,从而减少逆转录过程中的序列交叠,并方便用户测量 poly-A 尾的长度。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

首先使用本试剂盒提供的寡核苷酸,对含poly-A尾的全长RNA进行互补链合成和链转换。试剂盒内含24对不同引物,用于生成并PCR扩增双链cDNA。扩增引物内含5'端标签,可促成样本与快速测序接头的快速接合(不依赖连接酶)。混合扩增后的带条码样本,并向其中加入快速测序文库接头,即可得到用于测序的文库。

Chinese SQK-PCB11.24 Workflow

Protocols

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What's in the box

PCR-cDNA条形码测序试剂盒-24提供24种不同条形码,试剂可供制备六次文库:

Chinese SQK-PCB11.24 Kit Content

名称_缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
模板链转换引物 IISSPII蓝紫色1350
逆转录引物RTP黄色1200
cDNA 逆转录接头CRTA琥珀色1200
退火缓冲液AB橙色1200
快速测序文库接头TRAP T绿色110
快速测序文库接头稀释缓冲液RDBClear1100
洗脱缓冲液EB黑色21,500
短片段缓冲液SFB白色47,500
测序缓冲液 IISBII红色1500
上样颗粒 IILBII粉色1360
上样溶液LS白色管盖,粉色标签1400
条形码引物 1-24BP01-12白色1210
冲洗缓冲液FB蓝色61,170
冲洗系绳FLT白色管盖,紫色标签1200

Compatibility

PCR-cDNA条形码测序试剂盒-24 可与以下产品联用:

试剂盒

  • 测序芯片清洗试剂盒(EXP-WSH004)
  • 测序辅助扩展包(EXP-AUX002)

测序芯片

  • FLO-MIN106D
  • FLO-PRO002

测序设备

  • MinION Mk1B
  • MinION Mk1C
  • GridION
  • PromethION