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16S条形码测序试剂盒 1-24
SQK-16S024

通过添加条形码,为多达24个样本组成的混样文库进行“属”层级的细菌鉴定。

本产品采用试剂盒9系列试剂。

本品包含一个测序芯片预处理试剂盒

3发布
  • Oxford Nanopore Technologies 的产品已度过早期试用阶段
  • 用户可通过联系我们的客服提供反馈
  • 质保期延长至1-3个月
  • 产品不断演化,在升级前3个月内发布预告
  • 商店中显示交货时间
  • 产品视供货情况而定

Information

我们推荐有以下需求的用户使用该试剂盒:

  • 希望进行16S测序
  • 希望进行“属”层级上的细菌鉴定

请注意:使用本试剂盒,您需要购买额外的第三方试剂:详情请见“第三方材料”板块。

当单张测序芯片能产出的总数据量高于单个样本所需数据量时,将多个样本混样测序再进行条码拆分,可提高芯片的利用效率,并节省用户对单个样本的测序支出。

16S条形码测序试剂盒可为源自不同样本的约1500 bp的16S rRNA基因进行扩增、添加条码并混样测序。该方法通过缩小测序范围至感兴趣的基因组区域,使用户在免于检测非必要区域的同时,了解样本中含有的全部微生物,加快了细菌鉴定的速度并节约了成本。且相比分析外显子集,分析完整的16S rRNA基因可获得更多信息。

16S条形码测序试剂盒的特点:

特征详情
制备时间10 分钟 + PCR
起始材料要求<10 ng gDNA
是否需要PCR需要
片段化不需要
读长16S基因的全长 (~1.5 kb)
试剂盒所用试剂试剂盒9系列
相关实验指南扩增子快速建库测序 - 16S条形码 (SQK-16S024)
条码拆分选项• 16S条形码测序试剂盒 1-24
• 测序芯片清洗试剂盒
包装大小6次反应
稳定性运输温度 2–8℃

长期存储温度 -20℃

Oxford Nanopore Technologies规定产品质保期为交付之日起三个月内。

DNA样本由特定的16S引物(27F 和 1492R)扩增。该引物序列中包含条形码及促进样本与快速测序接头接合的5’端标签(不依赖连接酶)。本试剂盒内含24对引物。

本试剂盒受EPI2ME 16S-BLAST工作流程支持,该流程可用于分析经16S测序脚本产出的数据。MinKNOW及Guppy软件支持混样测序数据的条码拆分,并按条码将序列片段分类并分配至相应文件夹。

运输和物流:

测序芯片和试剂盒均置于环保且控温的装运箱中一起运输。

大陆地区工作日均可发货,根据运输情况1-3天到达。港澳台地区每周一从英国发货。

Workflow

DNA样本由特定的16S引物(27F 和 1492R)扩增。该引物序列中包含条形码及促进样本与快速测序接头接合的5’端标签(不依赖连接酶)。本试剂盒内含24对引物。

本试剂盒受EPI2ME 16S-BLAST工作流程支持,该流程可用于分析经16S测序脚本产出的数据。MinKNOW及Guppy软件支持混样测序数据的条码拆分,并按条码将序列片段分类并分配至相应文件夹。

Chinese SQK-16S024 Workflow

Protocols

16S条形码测序试剂盒 1-24(SQK-16S024)

请注册纳米孔社区账户,以获取上述实验指南。

What's in the box

16S条形码测序试剂盒1-24内含24种不同条码序列,可供制备六次文库。

16s024 v1

名称缩写管盖颜色管数每管溶液体积 (μl)
16S条形码引物 01-241-24-两板,每板三组每孔 15 μl
快速测序文库接头RAP绿色110
测序缓冲液SQB红色1300
上样颗粒LB粉色1360

测序芯片预处理试剂盒将一并供应。

Chinese FLP002 Content

名称缩写管盖颜色管数溶液体积 (μl)
冲洗缓冲液FB蓝色61.17 ml
冲洗系绳FLT紫色1200 µl

3rd party materials

耗材

  • Agencourt AMPure XP磁珠
  • 1.5ml Eppendorf DNA LoBind离心管
  • 0.2 ml薄壁PCR管
  • 无核酸酶水(如ThermoFisher,目录号AM9937)
  • 新制备的70%乙醇(用无核酸酶水配制)
  • LongAmp Taq 2X 预混液(如,NEB M0533S)
  • 含50 mM NaCl的10 mM Tris-HCl(pH 8.0)

器材

  • 迷你离心机
  • 计时器
  • 热循环仪
  • P1000移液枪和枪头
  • P100移液枪和枪头
  • P20移液枪和枪头
  • P10移液枪和枪头
  • P2移液枪和枪头
  • 多通道移液枪

可选器材

  • Agilent生物分析仪(或等效仪器)
  • Qubit荧光计(或用于质控检测的等效仪器)
  • Eppendorf 5424 离心机(或等效器材)

Compatibility

16S条形码测序试剂盒1-24可与以下产品联用:

试剂盒

  • 快速测序文库接头补充试剂盒(EXP-RAP001)
  • 测序芯片清洗试剂盒(EXP-WSH004)

测序芯片

  • FLO-MINSP6
  • FLO-MIN106D
  • FLO-FLG001

测序仪

  • MinION Mk1B
  • MinION Mk1C
  • GridION
  • Flongle